ВВЕДЕНИЕ
В наше время появилось новое вирусное заболевание под названием Covid-19 или коронавирус, которое почти сразу перевернуло наш мир с ног на голову. Мы все стали носить маски и перчатки в общественных местах, использовать литры антисептиков и пугаться любого кашля или чиха рядом с нами. Причина паники кроется в отсутствии подтвержденных фактов и распространения слухов.
Поэтому целью моего проекта стало исследовать коронавирус и методы его изучения.
Для достижения данной цели мы поставили перед собой следующие задачи:
Изучить структуру вируса и историю его возникновения
Проанализировать открытые статистические данные
Изучить методы исследования вирусов
Посетить лабораторию молекулярно-биологического анализа коронавируса
Провести опрос среди учеников и сотрудников школы АНОО «Ломоносовская школа – Зеленый мыс»
Составить памятку по коронавирусу для учеников и сотрудников школы
Изучить особенности вакцины от коронавируса
Провести биоинформационный анализ
Актуальность проблемы. В настоящее время проблема изучения и борьбы с коронавирусом актуальна для всех, ведь каждый из нас подвергнут риску заболевания. В группе риска находятся дети, пожилые люди, люди с онкологическими заболеваниями, с заболеваниями сердца и т. д.
Сейчас продолжается так называемая «вторая волна» данного заболевания. По данным на конец января каждый день в России выявляется более 19 тысяч заболевших, всего выявлено около 103 миллионов заболевших, из которых около 57 миллионов выздоровели.
На данный момент уже проведено более 102 миллионов тестов.
В России произведена первая в мире вакцина от коронавируса, и мы решили выяснить, на основе чего она работает.
Обзор литературных данных
Само название коронавирус показывает нам то, что это вирус, поэтому сначала более подробно познакомимся с ними.
1.1 Вирусы
Предполагается, что общее число вирусных частиц на порядок выше количества всех клеток всех организмов на Земле [4]. Вирусы окружают нас повсюду в живой природе, и каждая клетка каждого организма несет в себе следы прошлых встреч с ними.
Вирусы — это неклеточные формы жизни, различимые только под электронным микроскопом. Это внутриклеточные паразиты. За пределами клетки они не проявляют своих свойств и имеют кристаллическую форму [2].
Рисунок 1. Строение вируса |
Наиболее просто организованные вирусы представляют собой нуклеопротеид, состоящий из нуклеиновой кислоты (ДНК и РНК) и белковой оболочки (капсида). Сложные вирусы могут иметь дополнительную оболочку из липопротеина (рис.1). |
1.2 История возникновения коронавируса
Все, наверняка, слышали недовольные возгласы по типу «коронавирус уже давно существует, почему только сейчас он появился?» и, конечно же миф о том, что «коронавирус – это просто иностранное оружие». Но давайте ознакомимся с информацией от февраля 2020 года.
Сравнивая организмы друг с другом, эволюционные биологи многое могут узнать про их историю. Больше всего материала для сравнения содержится в нуклеотидных последовательностях, в случае коронавирусов – в последовательностях РНК. Текущая вспышка – пожалуй, первый случай возникновения нового патогена, когда генетические данные есть почти с самого начала. Первая последовательность «нового» коронавируса (nCoV) появилась в открытом доступе всего через несколько недель после описания первых случаев. Для сравнения: при вспышке SARS (тяжелого острого респираторного синдрома, также вызываемого коронавирусом) 2002/2003 года первых последовательностей пришлось ждать много месяцев [5].
Рисунок 3. Эволюционное дерево коронавирусов |
Ближайший родственник вирусных штаммов, давших начало этой вспышке (рис. 3), — это коронавирус, выделенный из летучей мыши. Между ним и эпидемическими штаммами совпадает около 96% нуклеотидов. Такая картина может означать, что вирус был передан от летучих мышей, хотя окончательные выводы о пути передачи делать рано. В любом случае все имеющиеся данные свидетельствуют о том, что инфекция была получена из природного резервуара. Чуть дальше расположены штаммы SARS, с которыми совпадает примерно 80% нуклеотидов, а еще дальше – штаммы MERS, ближневосточного респираторного синдрома. В последовательностях nCoV нет никаких свидетельств искусственной рекомбинации, вставок необычных фрагментов или какого-либо вмешательства [6]. |
Неизвестно, как мутации, отличающие nCoV от штаммов, распространенных у животных, изменили его характеристики и изменили ли вообще. Возможно, перескок был несчастной случайностью, не сопровождавшейся никакими изменениями генетических характеристик вируса по сравнению с его предками у диких животных.
1.3 Механизм развития коронавирусной инфекции
«Перескочив» в людей, вирус продолжил эволюционировать, «прорастив» ветвистое эволюционное древо уже в людях (рис. 4). К сожалению, сегодня известны лишь очень немногие «листья» этого древа. Самые новые последовательности из Уханя датируются 3 января, и 42 из 47 известных сегодня последовательностей получены снаружи Китая. Тем не менее, изучая древо, можно понять довольно много.
Рисунок 4. Эволюционное древо Covid-19.
Во-первых, можно установить скорость эволюции вируса. Для этого нужно сопоставить даты инфицирования с числом отличий последовательности вируса от «предковой». По текущим оценкам, скорость составляет порядка 0,001 замен на нуклеотид в год. Это сопоставимо с таковой у других РНК-содержащих вирусов, например, у гриппа. Это может означать, что, как в случае с гриппом, трудно будет создать универсальную вакцину, защищающую от всех штаммов, и вакцина потребует периодического обновления.
Во-вторых, можно проследить пути передачи. Первые надежные данные о передаче от человека человеку были получены именно таким образом.
В-третьих, можно оценить скорость распространения вируса, а именно ставший знаменитым в последние дни показатель Rо. Rо, или базовое репродуктивное число, — это число людей, зараженных одним инфицированным за все время течения болезни в полностью уязвимой популяции.
1.4 Динамика заболеваемости в России
Рисунок 5. Динамика заболеваемости в России. |
Первая волна: Февраль 2020: Сезонные вирусы в летние месяцы вытеснят коронавирус, заявил исполняющий обязанности директора НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева в Санкт-Петербурге Дмитрий Лиознов 25 июня 2020. По данным Worldometers на 25 июня 2020, коронавирусом в мире заразились 9 567 839 человек, 485 861 человек умер. В России зафиксировано 613 994 случая заболевания, выздоровели 375 164 человека, умерли 8605 заболевших. Стоит отметить, что к началу августа 2020 в столице наблюдается постепенный рост заболеваемости с 550 до 650 случаев в среднем за сутки. |
Это объясняется увеличением объемов бесплатного тестирования, но процент выявляемости также повышен с 10% до 13%. Вопреки прогнозам мэра, многие уверены в городе ожидается вторая волна коронавируса, из-за которой снова будут вводиться ограничительные мероприятия.
В течение всей эпидемии создавалась статистика возраста заболевших коронавирусом (рис. 5).
Что же происходит сейчас?
Рисунок 6. Число положительных проб на вирус гриппа [16]. |
В сентябре 2020 года началась вторая «вторая волна» коронавируса. По данным на 11 ноября заболело 19 860 человек. Москву снова закрыли на карантин, то есть закрыли учебные заведения, а офисы перешли на удаленную работу. А по данным на конец января 2021 года произошло снижение заболеваемости, в связи с чем частично ослабили карантинные меры. |
Интересно отметить, что в связи с повсеместным использованием средств индивидуальной защиты в период эпидемии отмечается резкое снижение заболеваемости гриппом (рис. 6)
Тема коронавируса активно исследуется в научной сфере, что ярко отображается в динамике публикационной активности (рис. 7). Первая публикация появилась в 1981 году, затем в последующие годы эта тема мало освещалась до 2019 года, когда вышло 272 статьи, а в 2020 данной тематике посвящено уже 89,5 тысяч публикаций. В 2021 году данная динамика скорее всего сохранится, так как на конец января по данным NCBI уже вышло почти 12 тысяч статей.
Рисунок 7. Статистика публикаций по коронавирусу.
1.5 Методы изучения вирусов
Методы исследования, применяемые в вирусологии, отличаются значительной сложностью, что связано прежде всего с абсолютным внутриклеточным паразитизмом вирусов и их малыми размерами. Существует достаточно много молекулярно-биологических методов изучения вирусов, например, ПЦР или культуральный метод. Но сейчас я расскажу о методах исследования различных вирусных инфекций и коронавируса конкретно.
При исследовании материалов, полученных от больных вирусными инфекциями, с целью лабораторной диагностики этих заболеваний применяются различные методы:
Методы электронной микроскопии
Метод иммунофлюоресценции
ИФА
Полимеразная цепная реакция
Метод молекулярной гибридизации
Секвенирование генома
Теперь о каждом более подробно.
1. Электронная микроскопия
Электронная микроскопия — это метод исследования структур, находящихся вне пределов видимости светового микроскопа и имеющих размеры менее одного микрона (от 1 мк до 1-5 A).
2. Метод иммунофлюоресценции
Рисунок 8. Люминесцентный микроскоп |
Иммунофлюоресцентный метод, или реакция иммунофлюоресценци (РИФ), используется в микробиологических лабораториях, оборудованных люминесцентным микроскопом (рис. 8). Люминесценция — нетепловое свечение вещества, происходящее после поглощения им энергии возбуждения. Флуоресценция (фосфоресценция) – это поглощение и последующее переизлучение света органическими и неорганическими образцами. Это явление является разновидностью люминесценции. |
3. ИФА
Иммуноферментный анализ — лабораторный иммунологический метод качественного или количественного определения различных низкомолекулярных соединений, макромолекул, вирусов и пр., в основе которого лежит специфическая реакция антиген-антитело.
4. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
Рисунок 11. Электрофорез молекул ДНК. |
Суть этого метода заключается в обнаружении специфического фрагмента ДНК или РНК вируса путём его многократного копирования в искусственных условиях. ПЦР можно проводить только с ДНК, то есть для РНК-вирусов предварительно необходимо произвести реакцию обратной транскрипции. |
7. Секвенирование генома
Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот – ДНК и РНК) — это определение их первичной аминокислотной или нуклеотидной последовательности. Раньше требовалось несколько человек и достаточно много времени для секвенирования, так как это делалось вручную (рис. 12). Сейчас появились специальные приборы для секвенирования поэтому это стало в разы быстрее (рис. 13). (уменьшились также размеры и стоимость этих приборов).
Рисунок 12. Результат секвенирования по Сэнгеру.
Рисунок 13. Современные приборы для секвенирования.
8. Биоинформационный анализ
Биоинформатика – развивающаяся междисциплинарная область, которая объединяет в себе общую и молекулярную биологию, кибернетику, генетику, химию, математику, статистику и информатику [13]. В настоящее время в открытых базах данных выложено много информации, но нужно суметь ее проанализировать. Именно этим занимается биоинформационный анализ.
1.6 Ген и его структура
Хотя гены присутствуют в виде сегментов ДНК во всех клеточных формах жизни, есть некоторые вирусы, генетическая информация которых находится в форме РНК. РНК-вирусы заражают клетку, которая затем немедленно начинает производить белки в соответствии с инструкциями вирусной РНК; транскрипция ДНК в РНК не требуется.
Для генов прокариот характерна оперонная структура. Оперон – это группа генов, которая контролирует один биохимический процесс. Например, широко известен лактозный оперон, который кодирует 3 гена метаболизма лактозы у бактерий.
1.7 Вакцины и методы их создания
ДНК- и РНК-вакцины
Рисунок 14. ДНК- и РНК-вакцины. |
Вакцины на основе нуклеиновых кислот не содержат ни вируса, ни его белков — только участки нуклеиновой кислоты, кодирующие информацию о строении определенного белка (чаще всего белка вирусной оболочки), к которому необходимо вызвать иммунный ответ (рис 14.). У вакцин на основе нуклеиновых кислот масса достоинств: они безопаснее живых и инактивированных; стимулируют оба вида иммунитета (клеточный и гуморальный); воздействуют на систему интерферонов; дают возможности для модификаций; исключен антивекторный иммунитет; |
У РНК-вакцин есть отдельные преимущества:
матричная РНК не накапливается в организме, так как расщепляется специальными ферментами (рибонуклеазами);
эти вакцины просты в разработке, и их производство можно наладить довольно
Недостатки ДНК- и РНК-вакцин:
Они не тестировались на больших количествах добровольцев
ДНК проникает в ядро клетки и потенциально может встроиться в геном.
ДНК может терять стабильность при хранении, а РНК — быстро разрушаться в клетках.
Нуклеиновые вакцины менее иммуногены.
Нуклеиновые кислоты кодируют образование белков, поэтому вакцины на их основе невозможно использовать против возбудителей с полисахаридной оболочкой (пневмококки, менингококки).
Векторные вакцины
Рисунок 15. Векторные вакцины. |
Векторные вакцины состоят из безопасного для человека вируса (вектора), в геном которого встроен ген, кодирующий вирусный белок. Например, для SARS-CoV-2 – это S-белок. Вместе с вакциной вектор попадает в кровоток, проникает в клетки и запускает синтез белков — тех самых шипиков оболочки коронавируса (рис.15). Сам вектор обычно не воспроизводится, так как нужные для этого гены «отключены». Благодаря этому векторные вакцины являются довольно безопасными [8]. |
Чтобы иммунитет не узнал вектор, используют вирусы, которые либо вообще не циркулируют среди людей (например, аденовирус шимпанзе), либо крайне редки или использовать два разных вирусных вектора. Данную технологию применяли специалисты НИИ им. Гамалеи при разработке вакцины против SARS-CoV-2.
Векторные вакцины на основе реплицирующегося вируса
С ними немного сложнее, так как это конструкция два-в-одном: берут уже существующий живой вакцинный вирус (например, вирус гриппа или кори), в геном которого встраивают нужный ген SARS-CoV-2. Попадая в клетки, такая вакцина должна обеспечивать защиту против кори или гриппа и COVID-19.
Живые, инактивированные, вирусоподобные и белковые вакцины
Рисунок 16. Живые, инактивированные, вирусоподобные и белковые вакцины [9]. |
Антигеном этих вакцин является либо вирион коронавируса (живой или инактивированный), либо вирусные белки, к которым формируется иммунный ответ. |
Фазы исследований вакцины
I фаза: исследование проводят на небольшом количестве добровольцев (до 50 человек). На этой стадии проверяют безопасность, выбирают приемлемую дозировку.
II фаза: вакцину прививают большему количеству добровольцев (обычно участвуют до 500 человек). Задача— проверка безопасности и иммуногенности, вводят плацебо-контроль.
Совмещенные исследования I/II фаз.
III фаза: участие принимают несколько тысяч добровольцев, проверяют эффективность вакцинации в защите от естественного заболевания.
Регистрация вакцины.
Постлицензионные исследования.
Перечень разрабатываемых вакцин от COVID-19
В стадии исследований на добровольцах находятся более 20 вакцин:
мРНК-вакцина американской компании Moderna (идет III фаза на 30 000 добровольцах)
Векторные вакцины от:
Центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» (I/II фаза);
University of Oxford и компании AstraZeneca (II фаза исследований в Великобритании и III — в Бразилии и Южной Африке);
ДНК-вакцина от Inovio (закончена I фаза);
инактивированная вакцина от Bharat Biotech (I/II фаза);
инактивированная вакцина от Sinopharm (III фаза);
и другие.
В России вышли 3 вакцины [10-12]. На основании анализа предлагаемых вакцин мы создали таблицу (Приложение, Таблица 1):
У каждой из данных вакцин присутствуют свои побочные эффекты и противопоказания, о чем вам подробно расскажут перед вакцинацией.
2. РЕЗУЛЬТАТЫ
Посещение лаборатории по выявлению коронавируса.
6 ноября 2020 года мы посетили лабораторию молекулярно-биохимических исследований Invitro (город Москва). В данной лаборатории проводится множество видов анализа, но наибольшее внимание мы уделили исследованиям по коронавирусу (см. Приложение 1). Большинство исследований автоматизировано. Был показан микробиологический отдел, в котором стоит роботизированная система WASP (см. Приложение 1), объединившая в себе автоматизированный процесс микробиологического посева, приготовление мазка и пересев в бульон.
В отделе биохимии в основном работают с образцами крови, там стоят поточные гематологические анализаторы Sysmex (см. Приложение 1).
Самое интересное было в отделе молекулярной биологии, где, в частности, проходит исследование проб на covid-19. Выделение ДНК происходит с помощью процессора магнитных частиц KingFisher Flex (см. Приложение 1).
Затем ставится real-time ПЦР, причем таких амплификаторов большое количество (см. Приложение 1).
Лаборатория in vitro очень современная, множество этапов анализа автоматизировано с применением соответствующей техники.
Опрос
12-13 ноября 2020 года мы провели опрос среди учащихся и работников АНОО «Ломоносовская школа – Зеленый мыс». Я опросила учеников из 4-11 классов, а также сотрудников. В опросе приняло участие 104 человека.
На вопрос «что такое коронавирус?» ответили 104 человека, среди них 60% сказали, что это вирус, 13% - болезнь или заболевание, 3% - Covid-19, 14% - предложили другие варианты ответа, а 10% ничего не ответили на данный вопрос.
Диаграмма 1 «что такое коронавирус?»
Внутри ответа «вирус» наблюдалась вариация: 8% сказали, что это грипп, а 6% - что это ОРВИ, а 86% никак не конкретизировали свой ответ.
Диаграмма 2 «Вирус»
Среди 104 опрошенных на вопрос «сколько человек из вашего окружения болели коронавирусом?» 40 человек ответили, что в их окружении не было заболевших, а при суммировании остальных ответов получилось 271 заболевший.
Мы проанализировали ответы, в которых указано в каком месяце люди переболели коронавирусной инфекцией. Заболевших с указанием месяца протекания заболевания оказалось 240 человек. Мы построили график, с учетом того, что в России данное заболевание впервые было диагностировано в феврале 2020 года.
График 1. Динамика заболеваемости коронавирусом.
Динамика заболеваемости по месяцам показала нам, что число заболевших во время второй волны намного превышает число заболевших во время первой волны.
К тому же, наш график полностью совпал с официальной статистикой по стране (рис. 5).
Мы проанализировали ответы, в которых был указан возраст заболевших.
Гистограмма 1. Количество заболевших коронавирусом по возрастам.
Результаты, представленные нами на гистограмме, показывают нам, что большая часть заболевших находится в возрасте от 40 до 50, что опять же совпадает со статистикой по стране (см. Раздел 1.4).
Составление памятки
После проведенного опроса мы решили составить памятку, содержащую информацию о мифах и методах борьбы с коронавирусом. Данную памятку мы представили ученикам и сотрудникам АНОО «Ломоносовской школы – Зеленый мыс» (см. Приложение 2).
Биоинформационный анализ
Используя открытую базу данных NCBI [14], мы рассмотрели структуру генома коронавируса (рис.17). Он содержит 29 903 пары нуклеотидных оснований (см. Приложение 3). Основную его часть составляет последовательности белка ORF. Это первый вирусный белок, создаваемый внутри зараженной клетки, он представляет собой цепь из 16 объединенных вместе белков [7]. Например, протеиназы разрывают связи между различными протеинами. Также присутствуют белки, содержащие трансмембранные домены для проникновения внутрь клетки. Хеликаза разрывает цепи ДНК во время копирования. РНК-полимераза участвует в синтезе новой цепи РНК.
Рисунок 17. Геномкоронавирусаsevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome (NCBI).
Мы проанализировали нуклеотидную последовательность коронавируса, взятую из открытой базы данных NCBI. Подсчет количества нуклеотидов (таблица 2) показал, что преобладают тиминовые основания, относящиеся к пиримидиновому ряду. На втором месте число аденинов, а гуанин и цитозин в меньшинстве.
Таблица 2. Количество нуклеотидов в геноме коронавируса
Азотистое основание |
Количество |
Аденин |
8944 |
Тимин |
9582 |
Гуанин |
5850 |
Цитозин |
5483 |
Отдельно присутствует последовательность S-белка, который формирует внешний слой коронавируса. Он содержит 3 822 пары нуклеотидных оснований. Именно на анализ последовательности данного белка направлено действие вакцины «спутник-V» российского производства. В трехмерной структуре данного белка мы видим обилие -спиралей, также присутствуют -складчатые слои. Помимо белковых структур еще выделяется 59 остатков замещенного моносахарида глюкопиранозы (2-ацетамидо-2-дезокси--D-гликопираноза) (рис. 19).
Рисунок 18. Пространственная структура S-белка |
Рисунок 19. 2-ацетамидо-2-дезокси--D-гликопираноза |
Используя программу BLAST [15], мы сравнили последовательность S-белка у различных штаммов коронавируса из базы данных NCBI. Показано 100%-ное соответствие нуклеотидов. Если построить филогенетическое древо, показывающее родство, (рис. 20) по данной последовательности, то почти все обнаруженные варианты коронавируса будут на одной ветви. Это служит доказательством того, что последовательность S-белка консервативна (малоизменчива) у коронавируса человека, поэтому вакцины, разработанные на его основе, будут успешно бороться с вирусом.
Рисунок 20. Филогенетическое древо коронавируса человека по соответствию последовательности S-белка
Используя последовательность гена S-белка из базы данных NCBI, мы составили праймеры для определения наличия последовательности данного белка в исследуемом образце.
Условия подбора праймеров
Анализ кодирующей области гена
Выбор участка длинной примерно 400 пар нуклеотидов
Последовательности, комплементарные праймерам, должны быть насыщены GC нуклеотидами и иметь размер примерно 20 нуклеотидов
Используя программу BLAST, мы проверили созданные нами праймеры во вкладке Primer-BLAST [17] (рис. 21):
CCCTCAGGGTTTTTCGGCTT - прямой праймер
AGATGCAAATCTGGTGGCGT - обратный праймер
Комплементарные праймерам последовательности указаны в Приложении 4. Предложенные нами праймеры имеют температуру отжига 60ºС и насыщены GC-парами (50 и 55%). На схеме указано положение
Рисунок 21. Результат проверки праймеров в программе Primer-BLAST.
Данные праймеры могут быть использованы для постановки real-time ПЦР, чтобы определить наличие коронавируса в пробе.
ВЫВОДЫ
На данный момент во всем мире коронавирусная инфекция вышла на первый план. В ходе нашего исследования мы добились следующих результатов:
Изучили структуру вируса и историю его возникновения.
Проанализировали открытые статистические данные.
Изучили методы исследования вирусов и способы создания вакцин.
Посетили лабораторию молекулярно-биологического анализа коронавируса и выявили, что основным методом является проведение real time ПЦР.
Проведенный в ноябре 2020 года опрос среди учеников и сотрудников школы АНОО «Ломоносовская школа – Зеленый мыс» показал, что большинство имеет представление что такое коронавирус. А также заболеваемость среди близкого окружения опрошенных в целом коррелирует с заболеваемостью в стране по месяцам и возрасту заболевших.
Составили памятку, содержащую информацию о мифах и способах борьбы с коронавирусом.
Провели биоинформационный анализ, который показал, что последовательность S-белка консервативна (малоизменчива) у коронавируса человека, поэтому вакцины, разработанные на его основе, будут успешно бороться с вирусом.
Мы разработали пару праймеров, которые могут быть использованы для определения наличия коронавируса в пробе методом real-time ПЦР.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Нас окружают миллионы разных частиц, которые стоят на границе живого и неживого – вирусы. Мы можем рассмотреть их только в электронный микроскоп, однако они оказывают на нашу жизнь огромное влияние. Еще год назад мало кто в нашей стране знал, что такое коронавирус, но уже весной это заболевание появилось в нашей стране. Поэтому мы заинтересовались данной тематикой. В настоящий момент о данном заболевании знают даже дети, что и показал наш опрос. Было крайне интересно сравнить динамику заболеваемости коронавирусом по стране с информацией о заболевших, которую нам рассказали ученики и сотрудники нашей школы. Действительно, изменение в заболеваемости полностью совпадает с примерами из жизни конкретных людей. Как официальная статистика по стране, так и данные о заболевших в нашей школе показали, что осенью 2020 года началась вторая волна коронавируса. Эта эпидемия изменила всю нашу жизнь. Во время первой волны весной 2020 года мы учились дистанционно и это было испытанием для нас. Также теперь во всех общественных местах мы пользуемся масками, перчатками и антисептиками. Данное заболевание показало уязвимость человека и важность соблюдения санитарно-гигиенических норм. Надеемся, что применение вакцин поможет человечеству побороть данную опасность. В свою очередь мы разработали праймеры, которые могут быть использованы в медицинской практике для выявления коронавируса.
Список использованной литературы
1) Носик Н. Н., Стаханова В. М. Лабораторная диагностика вирусных инфекций // «Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия», №2 том 2 2000
2) Авакян А. А., Быковский А. Ф. Атлас анатомии и онтогенеза вирусов человека и животных / «Медицина», Москва, 1970, 271 с.
3) Циммер К. Планета вирусов / «Феникс», Ростов-на-Дону, 2012, 78 с.
4) Букринская А. Г. Вирусология / «Медицина», Москва, 1986, 336 с.
5) Ржешевский А. Золотой век вирусов // «Популярная механика» №9, 2015
6) Киселев В. Вирус апокалипсиса // «Химия и жизнь» №4, 2020
7) Корум Дж. и Циммер К. Плохие новости в протеиновой обертке: в геноме у коронавируса (перевод Н. Шевченко) // «The New York Times», 3.04.2020
8) Ремиш А. Гонка во спасение: безопасны ли вакцины против коронавируса? // «Биомолекула», 11.08.2020
9) Callaway E. The race for coronavirus vaccines: a graphical guide // Nature, 580, 576-577; 2020.
10) Logunov D.Y, Dolzhikova I.V, Shcheblyakov D.V, Tukhvatulin A.I, Zubkova O.V, Dzharullaeva A.S, Kovyrshina A.V, Lubenets L.N, Grousova D.M, Erokhova A.S, Botikov AG et al. Safety and efficacy of an rAd26 and rAd5 vector-based heterologous prime-boost COVID-19 vaccine: an interim analysis of a randomised controlled phase 3 trial in Russia. // thelancet.com. «The Lancet» 2.02.2021. doi:10.1016/S0140-6736(21)00234-8.
11) ЭпиВакКорона Вакцина на основе пептидных антигенов для профилактики COVID-19 (EpiVacCorona Vaccine based on peptide antigens for prevention of COVID-19) // Электронный текст инструкции (временной) к препарату на сайте СЛС «Vidal».
12) Инструкция по медицинскому применению лекарственного препарата КовиВак (Вакцина коронавирусная инактивированная цельноварионная концентрированная очищенная) от 19.02.2021 г. // Электронный образ документа на сайте «Государственный реестр лекарственных средств».
13) Гельфанд, М. С. Биоинформатика как дисциплина: Биоинформатик Михаил Гельфанд о системной биологии, предсказании функций белков и процессах эволюции // Постнаука. — 2015. — 28 февраля.
14) https://www.ncbi.nlm.nih.gov
15) https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
16) https://apps.who.int/flumart/Default?ReportNo=6
17) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast
ПРИЛОЖЕНИЕ
1. Фото с экскурсии в лабораторию Invitro
1. Кабинет пробоподготовки и выделения нуклеиновых кислот
2. Лаборатория общеклинических исследований
3. Лаборатория общеклинических исследований
4. Лаборатория общеклинических исследований
5. Поточные гематологические анализаторы Sysmex
6. Лаборатория биохимии и иммунохимии
7. Лаборатория общеклинических исследований
8. Лаборатория общеклинических исследований
9. Роботизированная система WASP
10. Роботизированная система WASP
11. Отдел молекулярной биологии
12. Отдел молекулярной биологии
13. Отдел молекулярной биологии
14.Процессор магнитных частиц King Fisher Flex
15. Амплификаторы real-time ПЦР
16. Хранилище наборов для исследования инфекционных заболеваний
17. Хранилище наборов для исследования инфекционных заболеваний
2. Памятка «коронавирус и как с ним бороться»
Таблица 1. Сравнение существующих вакцин от коронавируса
Типы вакцин |
Векторные Спутник-V |
ДНК и РНК вакцины BNT162b2 Moderna |
Пептидная ЭпиВакКорона |
Инактивиро-ванные (мертвые) КовиВак |
Характеристика |
||||
Принцип действия |
Генетический материал вируса доставляется в клетку с помощью вектора – другого вируса, не вызывающего заболевание у человека. При проникновении вектора в клетку происходит синтез белков вируса и вируса-вектора и формируется противовирусный иммунный ответ |
Проникая в клетку, генно-инженерные конструкции на основе РНК или ДНК обеспечивают синтез нужного вирусного белка, после чего происходит формирование противовирусного иммунного ответа |
«ЭпиВакКорона» — создана на основе искусственно синтезированных элементов структуры коронавируса. Они вводятся пациенту, и у человека вырабатывается иммунитет к различным антигенам (фрагментам коронавируса). |
Для выработки противовирусного иммунитета вводится вирус, инактивированный термически или с применением химических агентов. Классическая технология, приближенная к естественному механизму формирования иммунитета. |
Преимущества |
Обладают высокой иммуногенностью Эффективность составляет 91,4%, против тяжелого течения заболевания - 100%. Ожидается, что иммунитет формируется на два года (на 9 месяцев - уже доказано). |
Простая и быстрая разработка эффективность более 90 % в предотвращении инфекции в течение семи дней после второй дозы. |
Менее токсична подходит для аллергиков и для людей с хроническими заболеваниями |
Длительное использование и уверенность в результате, формирование иммунитета естественным путем |
Недостатки |
Формируется иммунная реакция к вирусу-вектору, что может препятствовать формированию надлежащего иммунитета против целевого вируса |
Недостаточная изученность и отсутствие других зарегистрированных вакцин для использования среди людей |
относится к неживым вакцинам, у которых, иммунный ответ менее стойкий и длительный |
у 15 % привитых не выработались защитные антитела. Предполагается, что это может произойти позднее[ необходимость добавления адъювантов в случае с инактивированными вакцинами |
Как проходит вакцинация |
Вводится двукратно с интервалом 3 недели. Полноценный иммунный ответ вырабатывается через 3 недели после V2 (введения второго компонента вакцины), таким образом, на 42 день от момента начала курса вакцинации при соблюдении его сроков (3 недель между V1 и V2). |
Для полного курса вакцинации, после введения первой дозы вакцины Moderna COVID-19 необходимо получить вторую дозу через 3 недели-1месяц. Срок действия защитных свойств вакцины от COVID-19 в настоящее время неизвестен. |
Пептидные препараты не дают быстрый мощный ответ иммунитета, поэтому "ЭпиВакКорону" вводят дважды равными дозами с промежутком 21 день. |
Курс вакцинации предусматривает двукратное внутримышечное введение с интервалом 2 недели. |
3. Последовательностькоронавируса
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1
1 aggtaacaaa ccaaccaact ttcgatctct tgtagatctg ttctctaaac gaactttaaa
61 atctgtgtgg ctgtcactcg gctgcatgct tagtgcactc acgcagtata attaataact
121 aattactgtc gttgacagga cacgagtaac tcgtctatct tctgcagtct gcttacggtt
181 tcgtccgtgt tgcagccgat catcagcaca tctaggtttt gtccgggtgt gaccgaaagg
241 taagatggag agccttgtcc ctggtttcaa cgagaaaaca cacgtccaac tcagtttgcc
301 tgttttacag gttcgcgacg tgctcgtacg tggctttgga gactccgtgg aggaggtctt
361 atcagaggca cgtcaacatc ttaaagatgg cacttgtggc ttagtagaag ttgaaaaagg
421 cgttttgcct caacttgaac agccctatgt gttcatcaaa cgttcggatg ctcgaactgc
481 acctcatggt catgttatgg ttgagctggt agcagaactc gaaggcattc agtacggtcg
541 tagtggtgag acacttggtg tccttgtccc tcatgtgggc gaaataccag tggcttaccg
601 caaggttctt cttcgtaaga acggtaataa aggagctggt ggccatagtt acggcgccga
661 tctaaagtca tttgacttag gcgacgagct tggcactgat ccttatgaag attttcaaga
721 aaactggaac actaaacata gcagtggtgt tacccgtgaa ctcatgcgtg agcttaacgg
781 aggggcatac actcgctatg tcgataacaa cttctgtggc cctgatggct accctcttga
841 gtgcattaaa gaccttctag cacgtgctgg taaagcttca tgcactttgt ccgaacaact
901 ggactttatt gacactaaga ggggtgtata ctgctgccgt gaacatgagc atgaaattgc
961 ttggtacacg gaacgttctg aaaagagcta tgaattgcag acaccttttg aaattaaatt
1021 ggcaaagaaa tttgacacct tcaatgggga atgtccaaat tttgtatttc ccttaaattc
1081 cataatcaag actattcaac caagggttga aaagaaaaag cttgatggct ttatgggtag
1141 aattcgatct gtctatccag ttgcgtcacc aaatgaatgc aaccaaatgt gcctttcaac
1201 tctcatgaag tgtgatcatt gtggtgaaac ttcatggcag acgggcgatt ttgttaaagc
1261 cacttgcgaa ttttgtggca ctgagaattt gactaaagaa ggtgccacta cttgtggtta
1321 cttaccccaa aatgctgttg ttaaaattta ttgtccagca tgtcacaatt cagaagtagg
1381 acctgagcat agtcttgccg aataccataa tgaatctggc ttgaaaacca ttcttcgtaa
1441 gggtggtcgc actattgcct ttggaggctg tgtgttctct tatgttggtt gccataacaa
1501 gtgtgcctat tgggttccac gtgctagcgc taacataggt tgtaaccata caggtgttgt
1561 tggagaaggt tccgaaggtc ttaatgacaa ccttcttgaa atactccaaa aagagaaagt
1621 caacatcaat attgttggtg actttaaact taatgaagag atcgccatta ttttggcatc
1681 tttttctgct tccacaagtg cttttgtgga aactgtgaaa ggtttggatt ataaagcatt
1741 caaacaaatt gttgaatcct gtggtaattt taaagttaca aaaggaaaag ctaaaaaagg
1801 tgcctggaat attggtgaac agaaatcaat actgagtcct ctttatgcat ttgcatcaga
1861 ggctgctcgt gttgtacgat caattttctc ccgcactctt gaaactgctc aaaattctgt
1921 gcgtgtttta cagaaggccg ctataacaat actagatgga atttcacagt attcactgag
1981 actcattgat gctatgatgt tcacatctga tttggctact aacaatctag ttgtaatggc
2041 ctacattaca ggtggtgttg ttcagttgac ttcgcagtgg ctaactaaca tctttggcac
2101 tgtttatgaa aaactcaaac ccgtccttga ttggcttgaa gagaagttta aggaaggtgt
2161 agagtttctt agagacggtt gggaaattgt taaatttatc tcaacctgtg cttgtgaaat
2221 tgtcggtgga caaattgtca cctgtgcaaa ggaaattaag gagagtgttc agacattctt
2281 taagcttgta aataaatttt tggctttgtg tgctgactct atcattattg gtggagctaa
2341 acttaaagcc ttgaatttag gtgaaacatt tgtcacgcac tcaaagggat tgtacagaaa
2401 gtgtgttaaa tccagagaag aaactggcct actcatgcct ctaaaagccc caaaagaaat
2461 tatcttctta gagggagaaa cacttcccac agaagtgtta acagaggaag ttgtcttgaa
2521 aactggtgat ttacaaccat tagaacaacc tactagtgaa gctgttgaag ctccattggt
2581 tggtacacca gtttgtatta acgggcttat gttgctcgaa atcaaagaca cagaaaagta
2641 ctgtgccctt gcacctaata tgatggtaac aaacaatacc ttcacactca aaggcggtgc
2701 accaacaaag gttacttttg gtgatgacac tgtgatagaa gtgcaaggtt acaagagtgt
2761 gaatatcact tttgaacttg atgaaaggat tgataaagta cttaatgaga agtgctctgc
2821 ctatacagtt gaactcggta cagaagtaaa tgagttcgcc tgtgttgtgg cagatgctgt
2881 cataaaaact ttgcaaccag tatctgaatt acttacacca ctgggcattg atttagatga
2941 gtggagtatg gctacatact acttatttga tgagtctggt gagtttaaat tggcttcaca
3001 tatgtattgt tctttttacc ctccagatga ggatgaagaa gaaggtgatt gtgaagaaga
3061 agagtttgag ccatcaactc aatatgagta tggtactgaa gatgattacc aaggtaaacc
3121 tttggaattt ggtgccactt ctgctgctct tcaacctgaa gaagagcaag aagaagattg
3181 gttagatgat gatagtcaac aaactgttgg tcaacaagac ggcagtgagg acaatcagac
3241 aactactatt caaacaattg ttgaggttca acctcaatta gagatggaac ttacaccagt
3301 tgttcagact attgaagtga atagttttag tggttattta aaacttactg acaatgtata
3361 cattaaaaat gcagacattg tggaagaagc taaaaaggta aaaccaacag tggttgttaa
3421 tgcagccaat gtttacctta aacatggagg aggtgttgca ggagccttaa ataaggctac
3481 taacaatgcc atgcaagttg aatctgatga ttacatagct actaatggac cacttaaagt
3541 gggtggtagt tgtgttttaa gcggacacaa tcttgctaaa cactgtcttc atgttgtcgg
3601 cccaaatgtt aacaaaggtg aagacattca acttcttaag agtgcttatg aaaattttaa
3661 tcagcacgaa gttctacttg caccattatt atcagctggt atttttggtg ctgaccctat
3721 acattcttta agagtttgtg tagatactgt tcgcacaaat gtctacttag ctgtctttga
3781 taaaaatctc tatgacaaac ttgtttcaag ctttttggaa atgaagagtg aaaagcaagt
3841 tgaacaaaag atcgctgaga ttcctaaaga ggaagttaag ccatttataa ctgaaagtaa
3901 accttcagtt gaacagagaa aacaagatga taagaaaatc aaagcttgtg ttgaagaagt
3961 tacaacaact ctggaagaaa ctaagttcct cacagaaaac ttgttacttt atattgacat
4021 taatggcaat cttcatccag attctgccac tcttgttagt gacattgaca tcactttctt
4081 aaagaaagat gctccatata tagtgggtga tgttgttcaa gagggtgttt taactgctgt
4141 ggttatacct actaaaaagg ctggtggcac tactgaaatg ctagcgaaag ctttgagaaa
4201 agtgccaaca gacaattata taaccactta cccgggtcag ggtttaaatg gttacactgt
4261 agaggaggca aagacagtgc ttaaaaagtg taaaagtgcc ttttacattc taccatctat
4321 tatctctaat gagaagcaag aaattcttgg aactgtttct tggaatttgc gagaaatgct
4381 tgcacatgca gaagaaacac gcaaattaat gcctgtctgt gtggaaacta aagccatagt
4441 ttcaactata cagcgtaaat ataagggtat taaaatacaa gagggtgtgg ttgattatgg
4501 tgctagattt tacttttaca ccagtaaaac aactgtagcg tcacttatca acacacttaa
4561 cgatctaaat gaaactcttg ttacaatgcc acttggctat gtaacacatg gcttaaattt
4621 ggaagaagct gctcggtata tgagatctct caaagtgcca gctacagttt ctgtttcttc
4681 acctgatgct gttacagcgt ataatggtta tcttacttct tcttctaaaa cacctgaaga
4741 acattttatt gaaaccatct cacttgctgg ttcctataaa gattggtcct attctggaca
4801 atctacacaa ctaggtatag aatttcttaa gagaggtgat aaaagtgtat attacactag
4861 taatcctacc acattccacc tagatggtga agttatcacc tttgacaatc ttaagacact
4921 tctttctttg agagaagtga ggactattaa ggtgtttaca acagtagaca acattaacct
4981 ccacacgcaa gttgtggaca tgtcaatgac atatggacaa cagtttggtc caacttattt
5041 ggatggagct gatgttacta aaataaaacc tcataattca catgaaggta aaacatttta
5101 tgttttacct aatgatgaca ctctacgtgt tgaggctttt gagtactacc acacaactga
5161 tcctagtttt ctgggtaggt acatgtcagc attaaatcac actaaaaagt ggaaataccc
5221 acaagttaat ggtttaactt ctattaaatg ggcagataac aactgttatc ttgccactgc
5281 attgttaaca ctccaacaaa tagagttgaa gtttaatcca cctgctctac aagatgctta
5341 ttacagagca agggctggtg aagctgctaa cttttgtgca cttatcttag cctactgtaa
5401 taagacagta ggtgagttag gtgatgttag agaaacaatg agttacttgt ttcaacatgc
5461 caatttagat tcttgcaaaa gagtcttgaa cgtggtgtgt aaaacttgtg gacaacagca
5521 gacaaccctt aagggtgtag aagctgttat gtacatgggc acactttctt atgaacaatt
5581 taagaaaggt gttcagatac cttgtacgtg tggtaaacaa gctacaaaat atctagtaca
5641 acaggagtca ccttttgtta tgatgtcagc accacctgct cagtatgaac ttaagcatgg
5701 tacatttact tgtgctagtg agtacactgg taattaccag tgtggtcact ataaacatat
5761 aacttctaaa gaaactttgt attgcataga cggtgcttta cttacaaagt cctcagaata
5821 caaaggtcct attacggatg ttttctacaa agaaaacagt tacacaacaa ccataaaacc
5881 agttacttat aaattggatg gtgttgtttg tacagaaatt gaccctaagt tggacaatta
5941 ttataagaaa gacaattctt atttcacaga gcaaccaatt gatcttgtac caaaccaacc
6001 atatccaaac gcaagcttcg ataattttaa gtttgtatgt gataatatca aatttgctga
6061 tgatttaaac cagttaactg gttataagaa acctgcttca agagagctta aagttacatt
6121 tttccctgac ttaaatggtg atgtggtggc tattgattat aaacactaca caccctcttt
6181 taagaaagga gctaaattgt tacataaacc tattgtttgg catgttaaca atgcaactaa
6241 taaagccacg tataaaccaa atacctggtg tatacgttgt ctttggagca caaaaccagt
6301 tgaaacatca aattcgtttg atgtactgaa gtcagaggac gcgcagggaa tggataatct
6361 tgcctgcgaa gatctaaaac cagtctctga agaagtagtg gaaaatccta ccatacagaa
6421 agacgttctt gagtgtaatg tgaaaactac cgaagttgta ggagacatta tacttaaacc
6481 agcaaataat agtttaaaaa ttacagaaga ggttggccac acagatctaa tggctgctta
6541 tgtagacaat tctagtctta ctattaagaa acctaatgaa ttatctagag tattaggttt
6601 gaaaaccctt gctactcatg gtttagctgc tgttaatagt gtcccttggg atactatagc
6661 taattatgct aagccttttc ttaacaaagt tgttagtaca actactaaca tagttacacg
6721 gtgtttaaac cgtgtttgta ctaattatat gccttatttc tttactttat tgctacaatt
6781 gtgtactttt actagaagta caaattctag aattaaagca tctatgccga ctactatagc
6841 aaagaatact gttaagagtg tcggtaaatt ttgtctagag gcttcattta attatttgaa
6901 gtcacctaat ttttctaaac tgataaatat tataatttgg tttttactat taagtgtttg
6961 cctaggttct ttaatctact caaccgctgc tttaggtgtt ttaatgtcta atttaggcat
7021 gccttcttac tgtactggtt acagagaagg ctatttgaac tctactaatg tcactattgc
7081 aacctactgt actggttcta taccttgtag tgtttgtctt agtggtttag attctttaga
7141 cacctatcct tctttagaaa ctatacaaat taccatttca tcttttaaat gggatttaac
7201 tgcttttggc ttagttgcag agtggttttt ggcatatatt cttttcacta ggtttttcta
7261 tgtacttgga ttggctgcaa tcatgcaatt gtttttcagc tattttgcag tacattttat
7321 tagtaattct tggcttatgt ggttaataat taatcttgta caaatggccc cgatttcagc
7381 tatggttaga atgtacatct tctttgcatc attttattat gtatggaaaa gttatgtgca
7441 tgttgtagac ggttgtaatt catcaacttg tatgatgtgt tacaaacgta atagagcaac
7501 aagagtcgaa tgtacaacta ttgttaatgg tgttagaagg tccttttatg tctatgctaa
7561 tggaggtaaa ggcttttgca aactacacaa ttggaattgt gttaattgtg atacattctg
7621 tgctggtagt acatttatta gtgatgaagt tgcgagagac ttgtcactac agtttaaaag
7681 accaataaat cctactgacc agtcttctta catcgttgat agtgttacag tgaagaatgg
7741 ttccatccat ctttactttg ataaagctgg tcaaaagact tatgaaagac attctctctc
7801 tcattttgtt aacttagaca acctgagagc taataacact aaaggttcat tgcctattaa
7861 tgttatagtt tttgatggta aatcaaaatg tgaagaatca tctgcaaaat cagcgtctgt
7921 ttactacagt cagcttatgt gtcaacctat actgttacta gatcaggcat tagtgtctga
7981 tgttggtgat agtgcggaag ttgcagttaa aatgtttgat gcttacgtta atacgttttc
8041 atcaactttt aacgtaccaa tggaaaaact caaaacacta gttgcaactg cagaagctga
8101 acttgcaaag aatgtgtcct tagacaatgt cttatctact tttatttcag cagctcggca
8161 agggtttgtt gattcagatg tagaaactaa agatgttgtt gaatgtctta aattgtcaca
8221 tcaatctgac atagaagtta ctggcgatag ttgtaataac tatatgctca cctataacaa
8281 agttgaaaac atgacacccc gtgaccttgg tgcttgtatt gactgtagtg cgcgtcatat
8341 taatgcgcag gtagcaaaaa gtcacaacat tgctttgata tggaacgtta aagatttcat
8401 gtcattgtct gaacaactac gaaaacaaat acgtagtgct gctaaaaaga ataacttacc
8461 ttttaagttg acatgtgcaa ctactagaca agttgttaat gttgtaacaa caaagatagc
8521 acttaagggt ggtaaaattg ttaataattg gttgaagcag ttaattaaag ttacacttgt
8581 gttccttttt gttgctgcta ttttctattt aataacacct gttcatgtca tgtctaaaca
8641 tactgacttt tcaagtgaaa tcataggata caaggctatt gatggtggtg tcactcgtga
8701 catagcatct acagatactt gttttgctaa caaacatgct gattttgaca catggtttag
8761 ccagcgtggt ggtagttata ctaatgacaa agcttgccca ttgattgctg cagtcataac
8821 aagagaagtg ggttttgtcg tgcctggttt gcctggcacg atattacgca caactaatgg
8881 tgactttttg catttcttac ctagagtttt tagtgcagtt ggtaacatct gttacacacc
8941 atcaaaactt atagagtaca ctgactttgc aacatcagct tgtgttttgg ctgctgaatg
9001 tacaattttt aaagatgctt ctggtaagcc agtaccatat tgttatgata ccaatgtact
9061 agaaggttct gttgcttatg aaagtttacg ccctgacaca cgttatgtgc tcatggatgg
9121 ctctattatt caatttccta acacctacct tgaaggttct gttagagtgg taacaacttt
9181 tgactctgag tactgtaggc acggcacttg tgaaagatca gaagctggtg tttgtgtatc
9241 tactagtggt agatgggtac ttaacaatga ttattacaga tctttaccag gagttttctg
9301 tggtgtagat gctgtaaatt tacttactaa tatgtttaca ccactaattc aacctattgg
9361 tgctttggac atatcagcat ctatagtagc tggtggtatt gtagctatcg tagtaacatg
9421 ccttgcctac tattttatga ggtttagaag agcttttggt gaatacagtc atgtagttgc
9481 ctttaatact ttactattcc ttatgtcatt cactgtactc tgtttaacac cagtttactc
9541 attcttacct ggtgtttatt ctgttattta cttgtacttg acattttatc ttactaatga
9601 tgtttctttt ttagcacata ttcagtggat tgttatgttc acacctttag tacctttctg
9661 gataacaatt gcttatatca tttgtatttc cacaaagcat ttctattggt tctttagtaa
9721 ttacctaaag agacgtgtag tctttaatgg tgtttccttt agtacttttg aagaagctgc
9781 gctgtgcacc tttttgttaa ataaagaaat gtatctaaag ttgcgtagtg atgtgctatt
9841 acctcttacg caatataata gatacttagc tctttataat aagtacaagt attttagtgg
9901 agcaatggat acaactagct acagagaagc tgcttgttgt catctcgcaa aggctctcaa
9961 tgacttcagt aactcaggtt ctgatgttct ttaccaacca ccacaaacct ctatcacctc
10021 agctgttttg cagagtggtt ttagaaaaat ggcattccca tctggtaaag ttgagggttg
10081 tatggtacaa gtaacttgtg gtacaactac acttaacggt ctttggcttg atgacgtagt
10141 ttactgtcca agacatgtga tctgcacctc tgaagacatg cttaacccta attatgaaga
10201 tttactcatt cgtaagtcta atcataattt cttggtacag gctggtaatg ttcaactcag
10261 ggttattgga cattctatgc aaaattgtgt acttaagctt aaggttgata cagccaatcc
10321 taagacacct aagtataagt ttgttcgcat tcaaccagga cagacttttt cagtgttagc
10381 ttgttacaat ggttcaccat ctggtgttta ccaatgtgct atgaggccca atttcactat
10441 taagggttca ttccttaatg gttcatgtgg tagtgttggt tttaacatag attatgactg
10501 tgtctctttt tgttacatgc accatatgga attaccaact ggagttcatg ctggcacaga
10561 cttagaaggt aacttttatg gaccttttgt tgacaggcaa acagcacaag cagctggtac
10621 ggacacaact attacagtta atgttttagc ttggttgtac gctgctgtta taaatggaga
10681 caggtggttt ctcaatcgat ttaccacaac tcttaatgac tttaaccttg tggctatgaa
10741 gtacaattat gaacctctaa cacaagacca tgttgacata ctaggacctc tttctgctca
10801 aactggaatt gccgttttag atatgtgtgc ttcattaaaa gaattactgc aaaatggtat
10861 gaatggacgt accatattgg gtagtgcttt attagaagat gaatttacac cttttgatgt
10921 tgttagacaa tgctcaggtg ttactttcca aagtgcagtg aaaagaacaa tcaagggtac
10981 acaccactgg ttgttactca caattttgac ttcactttta gttttagtcc agagtactca
11041 atggtctttg ttcttttttt tgtatgaaaa tgccttttta ccttttgcta tgggtattat
11101 tgctatgtct gcttttgcaa tgatgtttgt caaacataag catgcatttc tctgtttgtt
11161 tttgttacct tctcttgcca ctgtagctta ttttaatatg gtctatatgc ctgctagttg
11221 ggtgatgcgt attatgacat ggttggatat ggttgatact agtttgtctg gttttaagct
11281 aaaagactgt gttatgtatg catcagctgt agtgttacta atccttatga cagcaagaac
11341 tgtgtatgat gatggtgcta ggagagtgtg gacacttatg aatgtcttga cactcgttta
11401 taaagtttat tatggtaatg ctttagatca agccatttcc atgtgggctc ttataatctc
11461 tgttacttct aactactcag gtgtagttac aactgtcatg tttttggcca gaggtattgt
11521 ttttatgtgt gttgagtatt gccctatttt cttcataact ggtaatacac ttcagtgtat
11581 aatgctagtt tattgtttct taggctattt ttgtacttgt tactttggcc tcttttgttt
11641 actcaaccgc tactttagac tgactcttgg tgtttatgat tacttagttt ctacacagga
11701 gtttagatat atgaattcac agggactact cccacccaag aatagcatag atgccttcaa
11761 actcaacatt aaattgttgg gtgttggtgg caaaccttgt atcaaagtag ccactgtaca
11821 gtctaaaatg tcagatgtaa agtgcacatc agtagtctta ctctcagttt tgcaacaact
11881 cagagtagaa tcatcatcta aattgtgggc tcaatgtgtc cagttacaca atgacattct
11941 cttagctaaa gatactactg aagcctttga aaaaatggtt tcactacttt ctgttttgct
12001 ttccatgcag ggtgctgtag acataaacaa gctttgtgaa gaaatgctgg acaacagggc
12061 aaccttacaa gctatagcct cagagtttag ttcccttcca tcatatgcag cttttgctac
12121 tgctcaagaa gcttatgagc aggctgttgc taatggtgat tctgaagttg ttcttaaaaa
12181 gttgaagaag tctttgaatg tggctaaatc tgaatttgac cgtgatgcag ccatgcaacg
12241 taagttggaa aagatggctg atcaagctat gacccaaatg tataaacagg ctagatctga
12301 ggacaagagg gcaaaagtta ctagtgctat gcagacaatg cttttcacta tgcttagaaa
12361 gttggataat gatgcactca acaacattat caacaatgca agagatggtt gtgttccctt
12421 gaacataata cctcttacaa cagcagccaa actaatggtt gtcataccag actataacac
12481 atataaaaat acgtgtgatg gtacaacatt tacttatgca tcagcattgt gggaaatcca
12541 acaggttgta gatgcagata gtaaaattgt tcaacttagt gaaattagta tggacaattc
12601 acctaattta gcatggcctc ttattgtaac agctttaagg gccaattctg ctgtcaaatt
12661 acagaataat gagcttagtc ctgttgcact acgacagatg tcttgtgctg ccggtactac
12721 acaaactgct tgcactgatg acaatgcgtt agcttactac aacacaacaa agggaggtag
12781 gtttgtactt gcactgttat ccgatttaca ggatttgaaa tgggctagat tccctaagag
12841 tgatggaact ggtactatct atacagaact ggaaccacct tgtaggtttg ttacagacac
12901 acctaaaggt cctaaagtga agtatttata ctttattaaa ggattaaaca acctaaatag
12961 aggtatggta cttggtagtt tagctgccac agtacgtcta caagctggta atgcaacaga
13021 agtgcctgcc aattcaactg tattatcttt ctgtgctttt gctgtagatg ctgctaaagc
13081 ttacaaagat tatctagcta gtgggggaca accaatcact aattgtgtta agatgttgtg
13141 tacacacact ggtactggtc aggcaataac agttacaccg gaagccaata tggatcaaga
13201 atcctttggt ggtgcatcgt gttgtctgta ctgccgttgc cacatagatc atccaaatcc
13261 taaaggattt tgtgacttaa aaggtaagta tgtacaaata cctacaactt gtgctaatga
13321 ccctgtgggt tttacactta aaaacacagt ctgtaccgtc tgcggtatgt ggaaaggtta
13381 tggctgtagt tgtgatcaac tccgcgaacc catgcttcag tcagctgatg cacaatcgtt
13441 tttaaacggg tttgcggtgt aagtgcagcc cgtcttacac cgttcggcac aggcactagt
13501 actgatgtcg tatacagggc ttttgacatc tacaatgata aagtagctgg ttttgctaaa
13561 ttcctaaaaa ctaattgttg tcgcttccaa gaaaaggacg aagatgacaa tttaattgat
13621 tcttactttg tagttaagag acacactttc tctaactacc aacatgaaga aacaatttat
13681 aatttactta aggattgtcc agctgttgct aaacatgact tctttaagtt tagaatagac
13741 ggtgacatgg taccacatat atcacgtcaa cgtcttacta aatacacaat ggcagacctc
13801 gtctatgctt taaggcattt tgatgaaggt aattgtgaca cattaaaaga aatacttgtc
13861 acatacaatt gttgtgatga tgattatttc aataaaaagg actggtatga ttttgtagaa
13921 aacccagata tattacgcgt atacgccaac ttaggtgaac gtgtacgcca agctttgtta
13981 aaaacagtac aattctgtga tgccatgcga aatgctggta ttgttggtgt actgacatta
14041 gataatcaag atctcaatgg taactggtat gatttcggtg atttcataca aaccacgcca
14101 ggtagtggag ttcctgttgt agattcttat tattcattgt taatgcctat attaaccttg
14161 accagggctt taactgcaga gtcacatgtt gacactgact taacaaagcc ttacattaag
14221 tgggatttgt taaaatatga cttcacggaa gagaggttaa aactctttga ccgttatttt
14281 aaatattggg atcagacata ccacccaaat tgtgttaact gtttggatga cagatgcatt
14341 ctgcattgtg caaactttaa tgttttattc tctacagtgt tcccacttac aagttttgga
14401 ccactagtga gaaaaatatt tgttgatggt gttccatttg tagtttcaac tggataccac
14461 ttcagagagc taggtgttgt acataatcag gatgtaaact tacatagctc tagacttagt
14521 tttaaggaat tacttgtgta tgctgctgac cctgctatgc acgctgcttc tggtaatcta
14581 ttactagata aacgcactac gtgcttttca gtagctgcac ttactaacaa tgttgctttt
14641 caaactgtca aacccggtaa ttttaacaaa gacttctatg actttgctgt gtctaagggt
14701 ttctttaagg aaggaagttc tgttgaatta aaacacttct tctttgctca ggatggtaat
14761 gctgctatca gcgattatga ctactatcgt tataatctac caacaatgtg tgatatcaga
14821 caactactat ttgtagttga agttgttgat aagtactttg attgttacga tggtggctgt
14881 attaatgcta accaagtcat cgtcaacaac ctagacaaat cagctggttt tccatttaat
14941 aaatggggta aggctagact ttattatgat tcaatgagtt atgaggatca agatgcactt
15001 ttcgcatata caaaacgtaa tgtcatccct actataactc aaatgaatct taagtatgcc
15061 attagtgcaa agaatagagc tcgcaccgta gctggtgtct ctatctgtag tactatgacc
15121 aatagacagt ttcatcaaaa attattgaaa tcaatagccg ccactagagg agctactgta
15181 gtaattggaa caagcaaatt ctatggtggt tggcacaaca tgttaaaaac tgtttatagt
15241 gatgtagaaa accctcacct tatgggttgg gattatccta aatgtgatag agccatgcct
15301 aacatgctta gaattatggc ctcacttgtt cttgctcgca aacatacaac gtgttgtagc
15361 ttgtcacacc gtttctatag attagctaat gagtgtgctc aagtattgag tgaaatggtc
15421 atgtgtggcg gttcactata tgttaaacca ggtggaacct catcaggaga tgccacaact
15481 gcttatgcta atagtgtttt taacatttgt caagctgtca cggccaatgt taatgcactt
15541 ttatctactg atggtaacaa aattgccgat aagtatgtcc gcaatttaca acacagactt
15601 tatgagtgtc tctatagaaa tagagatgtt gacacagact ttgtgaatga gttttacgca
15661 tatttgcgta aacatttctc aatgatgata ctctctgacg atgctgttgt gtgtttcaat
15721 agcacttatg catctcaagg tctagtggct agcataaaga actttaagtc agttctttat
15781 tatcaaaaca atgtttttat gtctgaagca aaatgttgga ctgagactga ccttactaaa
15841 ggacctcatg aattttgctc tcaacataca atgctagtta aacagggtga tgattatgtg
15901 taccttcctt acccagatcc atcaagaatc ctaggggccg gctgttttgt agatgatatc
15961 gtaaaaacag atggtacact tatgattgaa cggttcgtgt ctttagctat agatgcttac
16021 ccacttacta aacatcctaa tcaggagtat gctgatgtct ttcatttgta cttacaatac
16081 ataagaaagc tacatgatga gttaacagga cacatgttag acatgtattc tgttatgctt
16141 actaatgata acacttcaag gtattgggaa cctgagtttt atgaggctat gtacacaccg
16201 catacagtct tacaggctgt tggggcttgt gttctttgca attcacagac ttcattaaga
16261 tgtggtgctt gcatacgtag accattctta tgttgtaaat gctgttacga ccatgtcata
16321 tcaacatcac ataaattagt cttgtctgtt aatccgtatg tttgcaatgc tccaggttgt
16381 gatgtcacag atgtgactca actttactta ggaggtatga gctattattg taaatcacat
16441 aaaccaccca ttagttttcc attgtgtgct aatggacaag tttttggttt atataaaaat
16501 acatgtgttg gtagcgataa tgttactgac tttaatgcaa ttgcaacatg tgactggaca
16561 aatgctggtg attacatttt agctaacacc tgtactgaaa gactcaagct ttttgcagca
16621 gaaacgctca aagctactga ggagacattt aaactgtctt atggtattgc tactgtacgt
16681 gaagtgctgt ctgacagaga attacatctt tcatgggaag ttggtaaacc tagaccacca
16741 cttaaccgaa attatgtctt tactggttat cgtgtaacta aaaacagtaa agtacaaata
16801 ggagagtaca cctttgaaaa aggtgactat ggtgatgctg ttgtttaccg aggtacaaca
16861 acttacaaat taaatgttgg tgattatttt gtgctgacat cacatacagt aatgccatta
16921 agtgcaccta cactagtgcc acaagagcac tatgttagaa ttactggctt atacccaaca
16981 ctcaatatct cagatgagtt ttctagcaat gttgcaaatt atcaaaaggt tggtatgcaa
17041 aagtattcta cactccaggg accacctggt actggtaaga gtcattttgc tattggccta
17101 gctctctact acccttctgc tcgcatagtg tatacagctt gctctcatgc cgctgttgat
17161 gcactatgtg agaaggcatt aaaatatttg cctatagata aatgtagtag aattatacct
17221 gcacgtgctc gtgtagagtg ttttgataaa ttcaaagtga attcaacatt agaacagtat
17281 gtcttttgta ctgtaaatgc attgcctgag acgacagcag atatagttgt ctttgatgaa
17341 atttcaatgg ccacaaatta tgatttgagt gttgtcaatg ccagattacg tgctaagcac
17401 tatgtgtaca ttggcgaccc tgctcaatta cctgcaccac gcacattgct aactaagggc
17461 acactagaac cagaatattt caattcagtg tgtagactta tgaaaactat aggtccagac
17521 atgttcctcg gaacttgtcg gcgttgtcct gctgaaattg ttgacactgt gagtgctttg
17581 gtttatgata ataagcttaa agcacataaa gacaaatcag ctcaatgctt taaaatgttt
17641 tataagggtg ttatcacgca tgatgtttca tctgcaatta acaggccaca aataggcgtg
17701 gtaagagaat tccttacacg taaccctgct tggagaaaag ctgtctttat ttcaccttat
17761 aattcacaga atgctgtagc ctcaaagatt ttgggactac caactcaaac tgttgattca
17821 tcacagggct cagaatatga ctatgtcata ttcactcaaa ccactgaaac agctcactct
17881 tgtaatgtaa acagatttaa tgttgctatt accagagcaa aagtaggcat actttgcata
17941 atgtctgata gagaccttta tgacaagttg caatttacaa gtcttgaaat tccacgtagg
18001 aatgtggcaa ctttacaagc tgaaaatgta acaggactct ttaaagattg tagtaaggta
18061 atcactgggt tacatcctac acaggcacct acacacctca gtgttgacac taaattcaaa
18121 actgaaggtt tatgtgttga catacctggc atacctaagg acatgaccta tagaagactc
18181 atctctatga tgggttttaa aatgaattat caagttaatg gttaccctaa catgtttatc
18241 acccgcgaag aagctataag acatgtacgt gcatggattg gcttcgatgt cgaggggtgt
18301 catgctacta gagaagctgt tggtaccaat ttacctttac agctaggttt ttctacaggt
18361 gttaacctag ttgctgtacc tacaggttat gttgatacac ctaataatac agatttttcc
18421 agagttagtg ctaaaccacc gcctggagat caatttaaac acctcatacc acttatgtac
18481 aaaggacttc cttggaatgt agtgcgtata aagattgtac aaatgttaag tgacacactt
18541 aaaaatctct ctgacagagt cgtatttgtc ttatgggcac atggctttga gttgacatct
18601 atgaagtatt ttgtgaaaat aggacctgag cgcacctgtt gtctatgtga tagacgtgcc
18661 acatgctttt ccactgcttc agacacttat gcctgttggc atcattctat tggatttgat
18721 tacgtctata atccgtttat gattgatgtt caacaatggg gttttacagg taacctacaa
18781 agcaaccatg atctgtattg tcaagtccat ggtaatgcac atgtagctag ttgtgatgca
18841 atcatgacta ggtgtctagc tgtccacgag tgctttgtta agcgtgttga ctggactatt
18901 gaatatccta taattggtga tgaactgaag attaatgcgg cttgtagaaa ggttcaacac
18961 atggttgtta aagctgcatt attagcagac aaattcccag ttcttcacga cattggtaac
19021 cctaaagcta ttaagtgtgt acctcaagct gatgtagaat ggaagttcta tgatgcacag
19081 ccttgtagtg acaaagctta taaaatagaa gaattattct attcttatgc cacacattct
19141 gacaaattca cagatggtgt atgcctattt tggaattgca atgtcgatag atatcctgct
19201 aattccattg tttgtagatt tgacactaga gtgctatcta accttaactt gcctggttgt
19261 gatggtggca gtttgtatgt aaataaacat gcattccaca caccagcttt tgataaaagt
19321 gcttttgtta atttaaaaca attaccattt ttctattact ctgacagtcc atgtgagtct
19381 catggaaaac aagtagtgtc agatatagat tatgtaccac taaagtctgc tacgtgtata
19441 acacgttgca atttaggtgg tgctgtctgt agacatcatg ctaatgagta cagattgtat
19501 ctcgatgctt ataacatgat gatctcagct ggctttagct tgtgggttta caaacaattt
19561 gatacttata acctctggaa cacttttaca agacttcaga gtttagaaaa tgtggctttt
19621 aatgttgtaa ataagggaca ctttgatgga caacagggtg aagtaccagt ttctatcatt
19681 aataacactg tttacacaaa agttgatggt gttgatgtag aattgtttga aaataaaaca
19741 acattacctg ttaatgtagc atttgagctt tgggctaagc gcaacattaa accagtacca
19801 gaggtgaaaa tactcaataa tttgggtgtg gacattgctg ctaatactgt gatctgggac
19861 tacaaaagag atgctccagc acatatatct actattggtg tttgttctat gactgacata
19921 gccaagaaac caactgaaac gatttgtgca ccactcactg tcttttttga tggtagagtt
19981 gatggtcaag tagacttatt tagaaatgcc cgtaatggtg ttcttattac agaaggtagt
20041 gttaaaggtt tacaaccatc tgtaggtccc aaacaagcta gtcttaatgg agtcacatta
20101 attggagaag ccgtaaaaac acagttcaat tattataaga aagttgatgg tgttgtccaa
20161 caattacctg aaacttactt tactcagagt agaaatttac aagaatttaa acccaggagt
20221 caaatggaaa ttgatttctt agaattagct atggatgaat tcattgaacg gtataaatta
20281 gaaggctatg ccttcgaaca tatcgtttat ggagatttta gtcatagtca gttaggtggt
20341 ttacatctac tgattggact agctaaacgt tttaaggaat caccttttga attagaagat
20401 tttattccta tggacagtac agttaaaaac tatttcataa cagatgcgca aacaggttca
20461 tctaagtgtg tgtgttctgt tattgattta ttacttgatg attttgttga aataataaaa
20521 tcccaagatt tatctgtagt ttctaaggtt gtcaaagtga ctattgacta tacagaaatt
20581 tcatttatgc tttggtgtaa agatggccat gtagaaacat tttacccaaa attacaatct
20641 agtcaagcgt ggcaaccggg tgttgctatg cctaatcttt acaaaatgca aagaatgcta
20701 ttagaaaagt gtgaccttca aaattatggt gatagtgcaa cattacctaa aggcataatg
20761 atgaatgtcg caaaatatac tcaactgtgt caatatttaa acacattaac attagctgta
20821 ccctataata tgagagttat acattttggt gctggttctg ataaaggagt tgcaccaggt
20881 acagctgttt taagacagtg gttgcctacg ggtacgctgc ttgtcgattc agatcttaat
20941 gactttgtct ctgatgcaga ttcaactttg attggtgatt gtgcaactgt acatacagct
21001 aataaatggg atctcattat tagtgatatg tacgacccta agactaaaaa tgttacaaaa
21061 gaaaatgact ctaaagaggg ttttttcact tacatttgtg ggtttataca acaaaagcta
21121 gctcttggag gttccgtggc tataaagata acagaacatt cttggaatgc tgatctttat
21181 aagctcatgg gacacttcgc atggtggaca gcctttgtta ctaatgtgaa tgcgtcatca
21241 tctgaagcat ttttaattgg atgtaattat cttggcaaac cacgcgaaca aatagatggt
21301 tatgtcatgc atgcaaatta catattttgg aggaatacaa atccaattca gttgtcttcc
21361 tattctttat ttgacatgag taaatttccc cttaaattaa ggggtactgc tgttatgtct
21421 ttaaaagaag gtcaaatcaa tgatatgatt ttatctcttc ttagtaaagg tagacttata
21481 attagagaaa acaacagagt tgttatttct agtgatgttc ttgttaacaa ctaaacgaac
21541 aatgtttgtt tttcttgttt tattgccact agtctctagt cagtgtgtta atcttacaac
21601 cagaactcaa ttaccccctg catacactaa ttctttcaca cgtggtgttt attaccctga
21661 caaagttttc agatcctcag ttttacattc aactcaggac ttgttcttac ctttcttttc
21721 caatgttact tggttccatg ctatacatgt ctctgggacc aatggtacta agaggtttga
21781 taaccctgtc ctaccattta atgatggtgt ttattttgct tccactgaga agtctaacat
21841 aataagaggc tggatttttg gtactacttt agattcgaag acccagtccc tacttattgt
21901 taataacgct actaatgttg ttattaaagt ctgtgaattt caattttgta atgatccatt
21961 tttgggtgtt tattaccata aaaacaacaa aagttggatg gaaagtgagt tcagagttta
22021 ttctagtgcg aataattgca cttttgaata tgtctctcag ccttttctta tggaccttga
22081 aggaaaacag ggtaatttca aaaatcttag ggaatttgtg tttaagaata ttgatggtta
22141 ttttaaaata tattctaagc acacgcctat taatttagtg cgtgatctcc ctcagggttt
22201 ttcggcttta gaaccattgg tagatttgcc aataggtatt aacatcacta ggtttcaaac
22261 tttacttgct ttacatagaa gttatttgac tcctggtgat tcttcttcag gttggacagc
22321 tggtgctgca gcttattatg tgggttatct tcaacctagg acttttctat taaaatataa
22381 tgaaaatgga accattacag atgctgtaga ctgtgcactt gaccctctct cagaaacaaa
22441 gtgtacgttg aaatccttca ctgtagaaaa aggaatctat caaacttcta actttagagt
22501 ccaaccaaca gaatctattg ttagatttcc taatattaca aacttgtgcc cttttggtga
22561 agtttttaac gccaccagat ttgcatctgt ttatgcttgg aacaggaaga gaatcagcaa
22621 ctgtgttgct gattattctg tcctatataa ttccgcatca ttttccactt ttaagtgtta
22681 tggagtgtct cctactaaat taaatgatct ctgctttact aatgtctatg cagattcatt
22741 tgtaattaga ggtgatgaag tcagacaaat cgctccaggg caaactggaa agattgctga
22801 ttataattat aaattaccag atgattttac aggctgcgtt atagcttgga attctaacaa
22861 tcttgattct aaggttggtg gtaattataa ttacctgtat agattgttta ggaagtctaa
22921 tctcaaacct tttgagagag atatttcaac tgaaatctat caggccggta gcacaccttg
22981 taatggtgtt gaaggtttta attgttactt tcctttacaa tcatatggtt tccaacccac
23041 taatggtgtt ggttaccaac catacagagt agtagtactt tcttttgaac ttctacatgc
23101 accagcaact gtttgtggac ctaaaaagtc tactaatttg gttaaaaaca aatgtgtcaa
23161 tttcaacttc aatggtttaa caggcacagg tgttcttact gagtctaaca aaaagtttct
23221 gcctttccaa caatttggca gagacattgc tgacactact gatgctgtcc gtgatccaca
23281 gacacttgag attcttgaca ttacaccatg ttcttttggt ggtgtcagtg ttataacacc
23341 aggaacaaat acttctaacc aggttgctgt tctttatcag ggtgttaact gcacagaagt
23401 ccctgttgct attcatgcag atcaacttac tcctacttgg cgtgtttatt ctacaggttc
23461 taatgttttt caaacacgtg caggctgttt aataggggct gaacatgtca acaactcata
23521 tgagtgtgac atacccattg gtgcaggtat atgcgctagt tatcagactc agactaattc
23581 tcctcggcgg gcacgtagtg tagctagtca atccatcatt gcctacacta tgtcacttgg
23641 tgcagaaaat tcagttgctt actctaataa ctctattgcc atacccacaa attttactat
23701 tagtgttacc acagaaattc taccagtgtc tatgaccaag acatcagtag attgtacaat
23761 gtacatttgt ggtgattcaa ctgaatgcag caatcttttg ttgcaatatg gcagtttttg
23821 tacacaatta aaccgtgctt taactggaat agctgttgaa caagacaaaa acacccaaga
23881 agtttttgca caagtcaaac aaatttacaa aacaccacca attaaagatt ttggtggttt
23941 taatttttca caaatattac cagatccatc aaaaccaagc aagaggtcat ttattgaaga
24001 tctacttttc aacaaagtga cacttgcaga tgctggcttc atcaaacaat atggtgattg
24061 ccttggtgat attgctgcta gagacctcat ttgtgcacaa aagtttaacg gccttactgt
24121 tttgccacct ttgctcacag atgaaatgat tgctcaatac acttctgcac tgttagcggg
24181 tacaatcact tctggttgga cctttggtgc aggtgctgca ttacaaatac catttgctat
24241 gcaaatggct tataggttta atggtattgg agttacacag aatgttctct atgagaacca
24301 aaaattgatt gccaaccaat ttaatagtgc tattggcaaa attcaagact cactttcttc
24361 cacagcaagt gcacttggaa aacttcaaga tgtggtcaac caaaatgcac aagctttaaa
24421 cacgcttgtt aaacaactta gctccaattt tggtgcaatt tcaagtgttt taaatgatat
24481 cctttcacgt cttgacaaag ttgaggctga agtgcaaatt gataggttga tcacaggcag
24541 acttcaaagt ttgcagacat atgtgactca acaattaatt agagctgcag aaatcagagc
24601 ttctgctaat cttgctgcta ctaaaatgtc agagtgtgta cttggacaat caaaaagagt
24661 tgatttttgt ggaaagggct atcatcttat gtccttccct cagtcagcac ctcatggtgt
24721 agtcttcttg catgtgactt atgtccctgc acaagaaaag aacttcacaa ctgctcctgc
24781 catttgtcat gatggaaaag cacactttcc tcgtgaaggt gtctttgttt caaatggcac
24841 acactggttt gtaacacaaa ggaattttta tgaaccacaa atcattacta cagacaacac
24901 atttgtgtct ggtaactgtg atgttgtaat aggaattgtc aacaacacag tttatgatcc
24961 tttgcaacct gaattagact cattcaagga ggagttagat aaatatttta agaatcatac
25021 atcaccatat gttgatttag gtgacatctc tggcattaat gcttcagttg taaacattca
25081 aaaagaaatt gaccgcctca atgaggttgc caagaattta aatgaatctc tcatcgatct
25141 ccaagaactt ggaaagtatg agcagtatat aaaatggcca tggtacattt ggctaggttt
25201 tatagctggc ttgattgcca tagtaatggt gacaattatg ctttgctgta tgaccagttg
25261 ctgtagttgt ctcaagggct gttgttcttg tggatcctgc tgcaaatttg atgaagacga
25321 ctctgagcca gtgctcaaag gagtcaaatt acattacaca taaacgaact tatggatttg
25381 tttatgagaa tcttcacaat tggaactgta actttgaagc aaggtgaaat caaggatgct
25441 actccttcag attttgttcg cgctactgca acgataccga tacaagcctc actccctttc
25501 ggatggctta ttgttggcgt tgcacttctt gctgtttttc agagcgcttc caaaatcata
25561 accctcaaaa agagatggca actagcactc tccaagggtg ttcactttgt ttgcaacttg
25621 ctgttgttgt ttgtaacagt ttactcacac cttttgctcg ttgctgctgg ccttgaagcc
25681 ccttttctct atctttatgc tttagtctac ttcttgcaga gtataaactt tgtaagaata
25741 ataatgaggc tttggctttg ctggaaatgc cgttccaaaa acccattact ttatgatgcc
25801 aactattttc tttgctggca tactaattgt tacgactatt gtatacctta caatagtgta
25861 acttcttcaa ttgtcattac ttcaggtgat ggcacaacaa gtcctatttc tgaacatgac
25921 taccagattg gtggttatac tgaaaaatgg gaatctggag taaaagactg tgttgtatta
25981 cacagttact tcacttcaga ctattaccag ctgtactcaa ctcaattgag tacagacact
26041 ggtgttgaac atgttacctt cttcatctac aataaaattg ttgatgagcc tgaagaacat
26101 gtccaaattc acacaatcga cggttcatcc ggagttgtta atccagtaat ggaaccaatt
26161 tatgatgaac cgacgacgac tactagcgtg cctttgtaag cacaagctga tgagtacgaa
26221 cttatgtact cattcgtttc ggaagagaca ggtacgttaa tagttaatag cgtacttctt
26281 tttcttgctt tcgtggtatt cttgctagtt acactagcca tccttactgc gcttcgattg
26341 tgtgcgtact gctgcaatat tgttaacgtg agtcttgtaa aaccttcttt ttacgtttac
26401 tctcgtgtta aaaatctgaa ttcttctaga gttcctgatc ttctggtcta aacgaactaa
26461 atattatatt agtttttctg tttggaactt taattttagc catggcagat tccaacggta
26521 ctattaccgt tgaagagctt aaaaagctcc ttgaacaatg gaacctagta ataggtttcc
26581 tattccttac atggatttgt cttctacaat ttgcctatgc caacaggaat aggtttttgt
26641 atataattaa gttaattttc ctctggctgt tatggccagt aactttagct tgttttgtgc
26701 ttgctgctgt ttacagaata aattggatca ccggtggaat tgctatcgca atggcttgtc
26761 ttgtaggctt gatgtggctc agctacttca ttgcttcttt cagactgttt gcgcgtacgc
26821 gttccatgtg gtcattcaat ccagaaacta acattcttct caacgtgcca ctccatggca
26881 ctattctgac cagaccgctt ctagaaagtg aactcgtaat cggagctgtg atccttcgtg
26941 gacatcttcg tattgctgga caccatctag gacgctgtga catcaaggac ctgcctaaag
27001 aaatcactgt tgctacatca cgaacgcttt cttattacaa attgggagct tcgcagcgtg
27061 tagcaggtga ctcaggtttt gctgcataca gtcgctacag gattggcaac tataaattaa
27121 acacagacca ttccagtagc agtgacaata ttgctttgct tgtacagtaa gtgacaacag
27181 atgtttcatc tcgttgactt tcaggttact atagcagaga tattactaat tattatgagg
27241 acttttaaag tttccatttg gaatcttgat tacatcataa acctcataat taaaaattta
27301 tctaagtcac taactgagaa taaatattct caattagatg aagagcaacc aatggagatt
27361 gattaaacga acatgaaaat tattcttttc ttggcactga taacactcgc tacttgtgag
27421 ctttatcact accaagagtg tgttagaggt acaacagtac ttttaaaaga accttgctct
27481 tctggaacat acgagggcaa ttcaccattt catcctctag ctgataacaa atttgcactg
27541 acttgcttta gcactcaatt tgcttttgct tgtcctgacg gcgtaaaaca cgtctatcag
27601 ttacgtgcca gatcagtttc acctaaactg ttcatcagac aagaggaagt tcaagaactt
27661 tactctccaa tttttcttat tgttgcggca atagtgttta taacactttg cttcacactc
27721 aaaagaaaga cagaatgatt gaactttcat taattgactt ctatttgtgc tttttagcct
27781 ttctgctatt ccttgtttta attatgctta ttatcttttg gttctcactt gaactgcaag
27841 atcataatga aacttgtcac gcctaaacga acatgaaatt tcttgttttc ttaggaatca
27901 tcacaactgt agctgcattt caccaagaat gtagtttaca gtcatgtact caacatcaac
27961 catatgtagt tgatgacccg tgtcctattc acttctattc taaatggtat attagagtag
28021 gagctagaaa atcagcacct ttaattgaat tgtgcgtgga tgaggctggt tctaaatcac
28081 ccattcagta catcgatatc ggtaattata cagtttcctg tttacctttt acaattaatt
28141 gccaggaacc taaattgggt agtcttgtag tgcgttgttc gttctatgaa gactttttag
28201 agtatcatga cgttcgtgtt gttttagatt tcatctaaac gaacaaacta aaatgtctga
28261 taatggaccc caaaatcagc gaaatgcacc ccgcattacg tttggtggac cctcagattc
28321 aactggcagt aaccagaatg gagaacgcag tggggcgcga tcaaaacaac gtcggcccca
28381 aggtttaccc aataatactg cgtcttggtt caccgctctc actcaacatg gcaaggaaga
28441 ccttaaattc cctcgaggac aaggcgttcc aattaacacc aatagcagtc cagatgacca
28501 aattggctac taccgaagag ctaccagacg aattcgtggt ggtgacggta aaatgaaaga
28561 tctcagtcca agatggtatt tctactacct aggaactggg ccagaagctg gacttcccta
28621 tggtgctaac aaagacggca tcatatgggt tgcaactgag ggagccttga atacaccaaa
28681 agatcacatt ggcacccgca atcctgctaa caatgctgca atcgtgctac aacttcctca
28741 aggaacaaca ttgccaaaag gcttctacgc agaagggagc agaggcggca gtcaagcctc
28801 ttctcgttcc tcatcacgta gtcgcaacag ttcaagaaat tcaactccag gcagcagtaa
28861 acgaacttct cctgctagaa tggctggcaa tggcggtgat gctgctcttg ctttgctgct
28921 gcttgacaga ttgaaccagc ttgagagcaa aatgtctggt aaaggccaac aacaacaagg
28981 ccaaactgtc actaagaaat ctgctgctga ggcttctaag aagcctcggc aaaaacgtac
29041 tgccactaaa gcatacaatg taacacaagc tttcggcaga cgtggtccag aacaaaccca
29101 aggaaatttt ggggaccagg aactaatcag acaaggaact gattacaaac attggccgca
29161 aattgcacaa tttgccccca gcgcttcagc gttcttcgga atgtcgcgca ttggcatgga
29221 agtcacacct tcgggaacgt ggttgaccta cacaggtgcc atcaaattgg atgacaaaga
29281 tccaaatttc aaagatcaag tcattttgct gaataagcat attgacgcat acaaaacatt
29341 cccaccaaca gagcctaaaa aggacaaaaa gaagaaggct gatgaaactc aagccttacc
29401 gcagagacag aagaaacagc aaactgtgac tcttcttcct gctgcagatt tggatgattt
29461 ctccaaacaa ttgcaacaat ccatgagcag tgctgactca actcaggcct aaactcatgc
29521 agaccacaca aggcagatgg gctatataaa cgttttcgct tttccgttta cgatatatag
29581 tctactcttg tgcagaatga attctcgtaa ctacatagca caagtagatg tagttaactt
29641 taatctcaca tagcaatctt taatcagtgt gtaacattag ggaggacttg aaagagccac
29701 cacattttca ccgaggccac gcggagtacg atcgagtgta cagtgaacaa tgctagggag
29761 agctgcctat atggaagagc cctaatgtgt aaaattaatt ttagtagtgc tatcccca
29821 agaatgaca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa
29881 aa
4. Последовательность S-белка коронавируса c подобранными праймерами
1 atgtttgttt ttcttgtttt attgccacta gtctctagtc agtgtgttaa tcttacaacc
61 agaactcaat taccccctgc atacactaat tctttcacac gtggtgttta ttaccctgac
121 aaagttttca gatcctcagt tttacattca actcaggact tgttcttacc tttcttttcc
181 aatgttactt ggttccatgc tatacatgtc tctgggacca atggtactaa gaggtttgat
241 aaccctgtcc taccatttaa tgatggtgtt tattttgctt ccactgagaa gtctaacata
301 ataagaggct ggatttttgg tactacttta gattcgaaga cccagtccct acttattgtt
361 aataacgcta ctaatgttgt tattaaagtc tgtgaatttc aattttgtaa tgatccattt
421 ttgggtgttt attaccacaa aaacaacaaa agttggatgg aaagtgagtt cagagtttat
481 tctagtgcga ataattgcac ttttgaatat gtctctcagc cttttcttat ggaccttgaa
541 ggaaaacagg gtaatttcaa aaatcttagg gaatttgtgt ttaagaatat tgatggttat
601 tttaaaatat attctaagca cacgcctatt aatttagtgc gtgatctccc tcagggtttt
661 tcggctttagaaccattggt agatttgcca ataggtatta acatcactag gtttcaaact
721 ttacttgctt tacatagaag ttatttgact cctggtgatt cttcttcagg ttggacagct
781 ggtgctgcag cttattatgt gggttatctt caacctagga cttttctatt aaaatataat
841 gaaaatggaa ccattacaga tgctgtagac tgtgcacttg accctctctc agaaacaaag
901 tgtacgttga aatccttcac tgtagaaaaa ggaatctatc aaacttctaa ctttagagtc
961 caaccaacag aatctattgt tagatttcct aatattacaa acttgtgccc ttttggtgaa
1021 gtttttaacg ccaccagatt tgcatctgtt tatgcttgga acaggaagag aatcagcaac
1081 tgtgttgctg attattctgt cctatataat tccgcatcat tttccacttt taagtgttat
1141 ggagtgtctc ctactaaatt aaatgatctc tgctttacta atgtctatgc agattcattt
1201 gtaattagag gtgatgaagt cagacaaatc gctccagggc aaactggaaa gattgctgat
1261 tataattata aattaccaga tgattttaca ggctgcgtta tagcttggaa ttctaacaat
1321 cttgattcta aggttggtgg taattataat tacctgtata gattgtttag gaagtctaat
1381 ctcaaacctt ttgagagaga tatttcaact gaaatctatc aggccggtag cacaccttgt
1441 aatggtgttg aaggttttaa ttgttacttt cctttacaat catatggttt ccaacccact
1501 aatggtgttg gttaccaacc atacagagta gtagtacttt cttttgaact tctacatgca
1561 ccagcaactg tttgtggacc taaaaagtct actaatttgg ttaaaaacaa atgtgtcaat
1621 ttcaacttca atggtttaac aggcacaggt gttcttactg agtctaacaa aaagtttctg
1681 cctttccaac aatttggcag agacattgct gacactactg atgctgtccg tgatccacag
1741 acacttgaga ttcttgacat tacaccatgt tcttttggtg gtgtcagtgt tataacacca
1801 ggaacaaata cttctaacca ggttgctgtt ctttatcagg atgttaactg cacagaagtc
1861 cctgttgcta ttcatgcaga tcaacttact cctacttggc gtgtttattc tacaggttct
1921 aatgtttttc aaacacgtgc aggctgttta ataggggctg aacatgtcaa caactcatat
1981 gagtgtgaca tacccattgg tgcaggtata tgcgctagtt atcagactca gactaattct
2041 cctcggcggg cacgtagtgt agctagtcaa tccatcattg cctacactat gtcacttggt
2101 gcagaaaatt cagttgctta ctctaataac tctattgcca tacccacaaa ttttactatt
2161 agtgttacca cagaaattct accagtgtct atgaccaaga catcagtaga ttgtacaatg
2221 tacatttgtg gtgattcaac tgaatgcagc aatcttttgt tgcaatatgg cagtttttgt
2281 acacaattaa accgtgcttt aactggaata gctgttgaac aagacaaaaa cacccaagaa
2341 gtttttgcac aagtcaaaca aatttacaaa acaccaccaa ttaaagattt tggtggtttt
2401 aatttttcac aaatattacc agatccatca aaaccaagca agaggtcatt tattgaagat
2461 ctacttttca acaaagtgac acttgcagat gctggcttca tcaaacaata tggtgattgc
2521 cttggtgata ttgctgctag agacctcatt tgtgcacaaa agtttaacgg ccttactgtt
2581 ttgccacctt tgctcacaga tgaaatgatt gctcaataca cttctgcact gttagcgggt
2641 acaatcactt ctggttggac ctttggtgca ggtgctgcat tacaaatacc atttgctatg
2701 caaatggctt ataggtttaa tggtattgga gttacacaga atgttctcta tgagaaccaa
2761 aaattgattg ccaaccaatt taatagtgct attggcaaaa ttcaagactc actttcttcc
2821 acagcaagtg cacttggaaa acttcaagat gtggtcaacc aaaatgcaca agctttaaac
2881 acgcttgtta aacaacttag ctccaatttt ggtgcaattt caagtgtttt aaatgatatc
2941 ctttcacgtc ttgacaaagt tgaggctgaa gtgcaaattg ataggttgat cacaggcaga
3001 cttcaaagtt tgcagacata tgtgactcaa caattaatta gagctgcaga aatcagagct
3061 tctgctaatc ttgctgctac taaaatgtca gagtgtgtac ttggacaatc aaaaagagtt
3121 gatttttgtg gaaagggcta tcatcttatg tccttccctc agtcagcacc tcatggtgta
3181 gtcttcttgc atgtgactta tgtccctgca caagaaaaga acttcacaac tgctcctgcc
3241 atttgtcatg atggaaaagc acactttcct cgtgaaggtg tctttgtttc aaatggcaca
3301 cactggtttg taacacaaag gaatttttat gaaccacaaa tcattactac agacaacaca
3361 tttgtgtctg gtaactgtga tgttgtaata ggaattgtca acaacacagt ttatgatcct
3421 ttgcaacctg aattagactc attcaaggag gagttagata aatattttaa gaatcataca
3481 tcaccagatg ttgatttagg tgacatctct ggcattaatg cttcagttgt aaacattcaa
3541 aaagaaattg accgcctcaa tgaggttgcc aagaatttaa atgaatctct catcgatctc
3601 caagaacttg gaaagtatga gcagtatata aaatggccat ggtacatttg gctaggtttt
3661 atagctggct tgattgccat agtaatggtg acaattatgc tttgctgtat gaccagttgc
3721 tgtagttgtc tcaagggctg ttgttcttgt ggatcctgct gcaaatttga tgaagacgac
3781 tctgagccag tgctcaaagg agtcaaatta cattacacat aa
Желтым указаны последовательности, комплементарные праймерам, зеленым – получаемая последовательность