Введение
Современные способы получения энергии путем переработки горючих полезных ископаемых приводят к серьезному загрязнению окружающей среды. Поиск возобновляемых альтернативных способов получения энергии, связан, прежде всего, с использованием биосистем. Среди этих методов достаточно хорошо освоены биологические технологии превращения растительной биомассы в энергоносители (биогаз, биоэтанол, водород), так как растительные биомассы, вовлекаемые в процесс производства, характеризуются высоким содержанием целлюлозы. Активную роль в ее деструкции играют целлюлозолитические микроорганизмы. Микробная конверсия целлюлозы продолжает оставаться важнейшим направлением исследований в биотехнологии, в связи с этим активно ведется поиск и селекция микроорганизмов, способных к активной деструкции целлюлозы. Таким образом, создание коллекции целлюлозолитических микроорганизмов и получение биоэтанола из целлюлозосодержащего сырья при их участии – одна из важнейших научно-производственных задач.
В последние годы, в связи с ростом цен на традиционное углеводородное топливо, истощения запасов нефти и ухудшения экологической ситуации в мире все больше внимания уделяется поиску альтернативных источников энергии, способных достойно заменить нефтяное топливо. Решением этой проблемы является использование биотоплив. Согласно прогнозам, к 2030 г. в зависимости от региона биотопливо может занять от 10 до 30% совокупного энергетического потребления. В настоящее время около 90% мирового потребления биотоплива приходится на биоэтанол и биодизель [1, 2].
Существуют следующие причины необходимости получения и использования биотоплива в Республике Казахстан:
1. Развитие сельских регионов. 2. Уменьшение стоимости топлива. 3. Предотвращение загрязнения окружающей среды. 4. Снижение объема выбросов газов, вызывающих парниковый эффект и других ядовитых веществ.
В тоже время известно, что потребителями нефти являются автомобильный, авиационный и другие виды транспорта (60–65 мас. %); тепло- и электростанции (25–30 мас. %) и нефтехимическая промышленность (10–15 мас. %). Из этого следует, что почти 85–90 мас. % потребляемой нефти сжигается. Это порождает серьезную экологическую проблему. Основным продуктом сжигания нефти является двуокись углерода. Предполагают, что повышение содержания СО2 в атмосфере ведет к глобальному парниковому эффекту, потеплению и известным всем нам его последствиям. Вместе с СО2 в атмосферу выбрасывается огромное количество ядовитых веществ, которые наносят непоправимый ущерб всему биоразнообразию окружающей среды [2].
Эта проблема в сочетании с топливными кризисами выявила острую необходимость в поисках новых, более экологически чистых возобновляемых видов моторных топлив. К числу таковых относятся биоэтанол, биодизель и ряд других (диметиловый эфир, метан, водород и т.п.).
Целлюлозная биомасса является наиболее распространенным биологическим материалом на Земле. Исходная база для получения биоэтанола огромна и включает как пищевое, так и непищевое сырье. К растительным непищевым материалам, которые могут быть использованы в качестве гидролизного сырья, относятся различные отходы лесопиления и деревообработки (кора, стружка, щепа, шпон, дрова, опилки, древесная мука), отходы производства и переработки сельскохозяйственных культур (хлопковая шелуха и стебли хлопчатника, кукурузная кочерыжка, подсолнечная, рисовая и просяная лузга; костра льна; солома) и ряд дикорастущих растений [3-6].
Цель проекта: сформировать коллекцию целлюлозолитических штаммов аэробных микроорганизмов, перспективных для получения биоэтанола.
Задачи:
- выделение целлюлозолитических микроорганизмов из почвенных образцов;
- скрининг штаммов микроорганизмов с высокой целлюллазной активностью;
- экспериментальное доказательство возможности получения биоэтанола из целлюлозосодержащего сырья при участии микроорганизмов, осуществляющих его осахаривание.
Практическая база. Работа выполнена на кафедре биотехнологии КазНУ им.аль-Фараби, научный руководитель к.б.н., доцент Игнатова Л.В.
1. Выделение целлюлозолитических микроорганизмов
Целлюлозолитические микроорганизмы выделяли из образцов темно-каштановой почвы (г.Алматы), используя метод приманок [4]. Образцы почвы увлажняли до пастообразного состояния (60% от полной влагоёмкости) и тонким слоем вносили в стерильную чашку Петри. На поверхность почвенных образцов наносили приманки: кристаллическую целлюлозу, фильтровальную бумагу и газету. Тем самым добивались выделения определённых физиологических групп микроорганизмов, способных усваивать сложный субстрат (рисунок 1).
а б в
Рисунок 1 - Рост микроорганизмов на целлюлозосодержащих субстратах: а) 0 сутки; б) 14 сутки; в) 94 сутки.
Материал из зоны разложения отсевали на питательный агар для дальнейшей очистки и получения чистой культуры с последующим определением микроорганизмов (рис.2).
Рисунок 2 – Колонии целлюлозолитических микроорганизмов, выделенные из почвенных образцов
В результате было выделено 17 культур бактерий и 21 изолят микроскопических грибов.
При изучении бактерий обнаружили 5 морфотипов колоний:
Белые, гладкие, блестящие, край ровный. 2. Желтые, шероховатые, блестящие, выпуклые. 3. Оранжевые, блестящие, выпуклые. 4. Круглые, блестящие, гладкие колонии с желтоватым оттенком. 5. Колонии неправильной формы, фестончатый край, гладкая поверхность.
Морфология клеток бактерий приведенных выше типов колоний, представлена на рисунке 3.
1 тип |
2 тип |
3 тип |
|
4 тип |
5 тип |
Рисунок 3 - Морфология клеток целлюлозолитических бактерий
Все морфотипы бактерий представлены спорообразующими и неспорообразующими палочковидными клетками.
Среди выделенных изолятов микроскопических грибов были определены представители трех родов Aspergillus, Trichodermaи Penicillium.
В таблицах 1-3 и на рисунке 4 приведено описание культурально-морфологических особенностей выделенных грибов.
Таблица 1 - Макро- и микроморфология микроскопических грибов рода Aspergillus
Название рода |
Макроморфология |
Микроморфология |
Aspergillus |
Колонии войлочные по консистенции и слегка зональные, сначала белые, затем желтые. Диаметр колонии после культивирования на 8-ой день при 240С составлял 45-60 мм. |
Конидии при формировании грушевидные, при созревании становятся шаровидными, цепочки их собраны в радиальные головки |
а б
в г
а - колония штамма Р-1 на 8-ой день культивирования, б - микроморфология, в - формирующиеся конидии, г - верхушечная часть конидиеносца
д е
Рисунок 4- Микроморфология грибов рода Aspergillus
д – колония штамма Р-5 на 8-ой день, е – верхушечная часть конидиеносца
культивирования при 240С
Был проведён макро- и микроморфологический анализ грибов рода Trichoderma. Результаты анализа показаны в таблице 2 и на рисунке 5.
Таблица 2 - Морфологические особенности грибов рода Trichoderma
Название рода |
Макроморфология |
Микроморфология |
Trichoderma |
Колонии правильной округлой формы, быстрорастущие (до 90 мм в диаметре), белого цвета, по мере развития приобретают зеленоватый оттенок, становятся волосистыми. |
Конидиеносцы возникают из ветвей воздушного мицелия, разветвленные, с супротивно или очередными ответвлениями. Конидии верхушечные, продолговатые, гладкие, одиночные. |
а б
Рисунок 5 - Микроморфология грибов рода Trichoderma
а - колония на 14-ый день культивирования, б - разветвленный конидиеносец с верхушечными конидиями
Макро- и микроморфологический анализ грибов рода Penicillium показан в таблице 3 и на рисунке 6.
Таблица 3 - Макроморфология микроскопических грибов рода Penicillium
Название рода |
Макроморфология |
Микроморфология |
Penicillium |
Колонии пушисто-тяжистые, с широким белым краем во время ростазатем оливково-серые в старых культурах. |
Конидиеносцы отходят от субстрата или от воздушных гиф, с 1-2 веточками. Конидии вначале эллиптические, затем шаровидные |
а б
Рисунок 6 - Микроморфология грибов рода Penicillium
а - колония на 14-ый день культивирования, б - верхушечная часть конидиеносца
После микроскопирования чистые культуры микробов высевали штрихами на твердую среду Гетчинсона с 0,1 % натриевой солью карбоксиметилцеллюлозы (Na- КЦМ) для подтверждения способности изолятов усваивать целлюлозу в качестве единственного источника углерода [7-9].
В результате проделанной работы из почвенных образцов выделено 28 изолятов микроорганизмов, способных расти на среде с целлюлозой в качестве единственного источника углерода. На следующем этапе работы у всех выделенных культур определялся уровень целлюлозолитической активности.
Скрининг штаммов состоял из нескольких этапов. На первом из них полученные изоляты высевали на твердую агаризованную среду Гетчинсона с 0,1% Na- КЦМ для подтверждения их способности усваивать целлюлозу и определения уровня целлюллазной активности (табл.4-5).
Таблица 4 - Целлюллазная активность бактерий, выделенных из почвы
Тип колоний |
Общее количество штаммов |
Количество активных штаммов в отношении Na-КМЦ (диаметр зон гидролиза, мм) |
|||
0-10 |
10-15 |
15-20 |
20-25 |
||
Контроль |
12 |
3 |
2 |
5 |
2 |
1 |
2 |
0 |
1 |
1 |
0 |
2 |
3 |
0 |
1 |
1 |
1 |
3 |
2 |
0 |
0 |
2 |
0 |
4 |
3 |
2 |
0 |
1 |
0 |
5 |
2 |
1 |
0 |
0 |
1 |
Таблица 5 - Целлюллазная активность микроскопических грибов, выделенных из почвы
Род |
Общее количество штаммов |
Количество активных штаммов в отношении Na-КМЦ (диаметр зон гидролиза, мм) |
|||
0-10 |
10-15 |
15-20 |
20-25 |
||
Контроль |
16 |
3 |
4 |
6 |
3 |
Aspergillus |
6 |
0 |
2 |
2 |
2 |
Trichoderma |
5 |
2 |
0 |
2 |
1 |
Penicillium |
5 |
1 |
2 |
2 |
0 |
Исследование изолятов микроорганизмов различных морфологических типов проводили по измерению диаметра зон просветления окраски вокруг выросших колоний после прокрашивания чашек красителем конго красным и раствором Люголя [6].
В соответствии с имеющимися литературными данными [6], зона гидролиза до 10 мм свидетельствует о низкой ферментативной активности, в диапазоне 10-20 мм о ее среднем уровне, и только свыше 20 мм высоком. Согласно полученным данным, 6 штаммов проявили низкую активность (зона гидролиза- 0-10 мм). Большинство штаммов (17) проявили средний уровень активности – зона гидролиза 10-20 мм. 5 изолятов обладали высокой активностью в данном тесте (рисунок 7, 8).
Рисунок 7 - Зоны гидролиза Na-КМЦ штаммами грибов при окрашивании конго красным
Рисунок 8 - Целлюлозолитическая активность выделенных штаммов при окрашивании колоний раствором Люголя.
На втором этапе скрининга у штаммов, вокруг колоний которых выявлены зоны гидролиза КМЦ более 20 мм, целлюлозолитическую активность определяли весовым методом. Суть этого метода заключается в определении весовой убыли целлюлозы после инкубирования с культурами микроорганизмов. Для этого исследуемые штаммы засевали в жидкую среду, в которой в качестве источника целлюлозы использовали фильтровальную бумагу «Filtrak» № 88. Учет убыли субстрата проводили через 24-72 часа инкубации, отбирая каждый раз по 3 пробы. Показателем целлюлозолитичсекой активности штаммов служила величина изменения веса целлюлозы, выражаемая в процентах от исходного значения. Результаты этих анализов приведены в таблице 6.
В результате скрининга были отобраны штаммы, в которых была отмечена убыль массы фильтра более чем на 18%. Это 3 штамма - Р-2, Р-4, Р-5. После их культивирования на среде с целлюлозой (фильтровальная бумага) происходила деградация последней на 18,96-19,21%.
Таблица 6 – Расщепление целлюлозы штаммами микроорганизмов
Номер изолята |
24 часа |
48 часов |
72 часа |
|||
Убыль массы фильтра, г |
% от исходного веса |
Убыль массы фильтра, г |
% от исходного веса |
Убыль массы фильтра, г |
% от исходного веса |
|
Контроль |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
Р-1 |
0,002±0,001 |
0,74 |
0,004±0,005 |
1,12 |
0,028±0,005 |
9,42 |
Р-2 |
0,007±0,001 |
3,63 |
0,016±0,005 |
5,09 |
0,070±0,009 |
19,23 |
Р-3 |
0,003±0,001 |
0,58 |
0,006±0,003 |
1,36 |
0,022±0,008 |
9,39 |
Р-4 |
0,011±0,0001 |
3,79 |
0,024±0,002 |
6,89 |
0,069±0,009 |
19,21 |
Р-5 |
0,012±0,0003 |
3,81 |
0,024±0,003 |
7,01 |
0,059±0,008 |
18,96 |
Таким образом, двуступенчатый скрининг 38 изолятов по уровню активности ферментов, определяемому в чашечном и весовом тесте позволил отобрать 3 активных штамма: Р-2, Р-4 и Р-5.
1.3. Определение возможности получения биоэтанола из целлюлозосодержащего сырья при участии микроорганизмов
Одним из наиболее привлекательных направлений получения биоэтанола является использование в качестве сырья целлюлозосодержащих отходов сельского хозяйства и деревообработки. Главной задачей превращения такого сырья в этанол является предварительная подготовка к ферментации [17-18]. Одна из задач проводимого исследования – экспериментальное доказательство возможности получения биоэтанола из целлюлозосодержащего сырья при участии микроорганизмов, осуществляющих его осахаривание. Для этого была проведена серия специальных экспериментов.
Культуры целлюлозолитических микроорганизмов выращивали в течение 3 дней в шейкере-инкубаторе при 37° C на питательной среде ФС-1, содержащей подсолнечный шрот. В наших экспериментах целлюлозосодержащим субстратом служила не «чистая целлюлоза», а измельченный в кофемолке подсолнечный шрот, который вносили в ферментационную среду в количестве 1%. Полученные в экспериментах и представленные в таблице 18 данные подтвердили возможность использования измельченного шрота для .образования биоэтанола.
После завершения инкубации, в культуральный бульон добавляли дрожжи Saccharomycescerevisae ИС-53 (суспендированные в стерильном солевом растворе). Ферментация проводились при 27° С в течение 5 дней в стационарном состоянии. Доза инокулята составляла 10%. Дрожжи находились в экспоненциальной фазе развития.
Процент содержания спирта в культуральной жидкости к концу культивирования определяли с реагентом K2Cr2O7 [14]. Результаты этих экспериментов, представленные в таблице 8 свидетельствуют об образовании этанола из подсолнечного шрота за счет осахаривания его целлюлозолитическими микроорганизмами с последующим сбраживанием образовавшихся в среде сахаров дрожжами.
Таблица 8 – Образование биоэтанола из подсолнечного шрота в процессе совместного культивирования целлюлозолитических бактерий и дрожжей
Штамм |
Содержание биоэтанола (%) после дрожжевой ферментации |
ФС-1 (подсолнечный шрот) |
|
Р-1 |
0,20±0,012 |
Р-2 |
0,25±0,014 |
Р-3 |
0,23±0,012 |
Р-4 |
0,24±0,013 |
Р-5 |
0,30±0,011 |
Р-2 + Р-4 |
0,23±0,010 |
Р-2 + Р5 |
0,34±0,016 |
Р-4 + Р5 |
0,39±0,021 |
Р-2 + Р-4+Р-5 |
0,41±0,048 |
Следовательно, значительная деградация целлюлозы может быть достигнута в смешанной культуре целлюлозолитических микроорганизмов и нецеллюлозолитических дрожжей Saccharomyces cereviseae, в которых дрожжи используют редуцирующий сахар, полученный путем микробной конверсии целлюлозы, и преобразовывают его в этанол. Этот результат отражает высокий целлюлолитический потенциал отобранных микробных штаммов.
Таким образом, проведенные исследования по формированию коллекции целлюлозолитических штаммов аэробных микроорганизмов, перспективных для получения биоэтанола позволили установить следующие выводы:
1.Из почвенных образцов выделено 28 изолятов микроорганизмов, способных расти на среде с целлюлозой в качестве единственного источника углерода.
2. В результате двухступенчатого скрининга были отобраны 3 штамма микроорганизмов (Р-2, Р-4, Р-5), колонии которых обладали наибольшей зоной «гало» при окрашивании красителем конго красным и раствором Люголя, а также характеризующиеся убылью массы фильтра более чем на 18%.
3. Получен биоэтанол на среде, содержащей подсолнечный шрот помощью целлюлозолитических микроорганизмов и штамма Saccharomyces сerevisiae ИС-53.
Lynd L.R., Cushman J.H., Nichols R.J., Wyman C.E. Fuel ethanol from cellulosic biomass. Science. 1991. - № 251. – Р.318–1323.
Матковский П.Е., Яруллин Р.С., Старцева Г.П., Седов И.В. Биоэтанол: технологии получения из возобновляемого растительного сырья и области применения // Международный научный журнал «Альтернативная энергетика и экология». - № 6 (86). – 2010. - С. 95-105.
Мокрушина Н.С., Тарасова Т.С., Дармов И.В. Биоконверсия древесных отходов методом компостирования с получением органического удобрения // Известия Самарского научного центра РАН. - 2009. - Т.11. - №1. - С.228-232.
Мокрушина Н.С., Тарасова Т.С., Дармов И.В. Выделение микромицетов, перспективных для разработки на их основе биопрепарата для ускоренной переработки древесных отходов в удобрение // Вестник Нижегородского университета им. Н.И.Лобачевского. - 2010, №2. - С.430-434.
Рабинович М.Л., Мельник М.С., Болобова А.В. Целлюлазы микроорганизмов // Прикладная биохимия и микробиология.- 2002.- Т.38.- №4. - С.355-373.
Осадчая А.И., Сафронова Л.А., Авдеева Л.В., Иляш В.М. Скрининг штаммов с высокой целлюлазной активностью // Микробиологичный журнал. – 2009. – Т.71. - № 5. – С.41-48.
Авдеева Л.В., Осадчая А.И., Хархота М.А. Целлюлазная активность бактерий рода Bacillus // Мiкробiологiя и бiотехнологiя. - 2011. - №2. - С.65-72.
Pratima G., Kalpana S., Avinash S. Isolation of Cellulose-Degrading Bacteria and Determination of Their Cellulolytic Potential // International Journal of Microbiology. – 2012. – P.1-3.
Панкратов Т. А., Дедыш С. Н., Заварзин Г. А. Ведущая роль представителей Actinobacteriaв процессах аэробной деструкции целлюлозы в сфагновых болотах // ДАН. - 2006. - Т.410. - № 4. - С.438 - 442.
Balamurugan A., Jayanthi R., Nepolean P., Vidhya R. Pallavi and R. Premkumar Studies on cellulose degrading bacteria in tea garden soils // African Journal of Plant Science. - 2011. - Vol 5 (1). - Р. 22-27.
Barman D., Saud Z.A., Habib M.R., Islam M.F., Hossain K., Yeasmin T. Isolation of Cellulytic Bacterial Strains from Soil for Effective and Efficient Bioconversion of Solid Waste // Life Sciences and Medicine Research.- Volume 2011. - Р.1-7.
Острикова Н.А., Коновалов С.А.Биосинтез комплекса целлюлозоразрушающих ферментов смешанным культивированием микроорганизмов// Биотехнология. – 1986. –№3. – С.62–68.
Анкудимова Н.В., Баразненок В.А., Беккер Е.Г., Окунев О.Н. Целлюлазный комплекс Chaetomiumcellulyticum: выделение и свойства основных компонентов // Биохимия.- 1999. - Т.64. - В. 9. – С. 1267-1273.
Pratima Gupta, Kalpana Samant, and Avinash Sahu Isolation of Cellulose-Degrading Bacteria and Determination of their cellulolytic potential // International Journal of Microbiology. – 2012. – Vol. 2012. - P. 5.
Waghmare P. R., Patil S. M., Jadhav S. L., Byong-Hun Jeon. Utilization of agricultural waste biomass by cellulolytic isolate Enterobacter sp. Suk-bio // Govindwar agriculture and natural resources. - 52 (2018). – P. 399-406.
Saratale, G.D., Saratale, R.G., Oh, S.E. Production and characterization of multiple cellulolytic enzymes by isolated Streptomyces sp. // MDS Biomass Bioenergy. – 2012. -47. – Р. 302-315.
Sarkar, N., Ghosh, S.K., Bannerjee, S., Aikat, K. Bioethanol production from agricultural wastes: an overview // Renew. Energy. – 2012. -37. – Р. 19-27.
El-Dalatony, M.M., Kurade, M.B., Abou-Shanab, R.A.I., Kim, H., Salama, E.S., Jeon, B.H. Long-term production of bioethanol in repeated-batch fermentation of microalgal biomass using immobilized Saccharomyces cerevisiae // Bioresour. Technol.- 2016. -219. – Р. 98-105.